RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 MFSD10Q14728 455 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 WASHC4Q2M389 1173 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 OTOP1Q7RTM1 612 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 WNT2BQ93097 391 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 H0YGN5 161 aa8.73□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 C6orf229H3BNL8 230 aa8.73□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHDP01880 384 aa8.73□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 TM4SF4P48230 202 aa8.73□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 GRAPQ13588 217 aa8.73□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 NFE2L2Q16236 605 aa8.73□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 POLLQ9UGP5 575 aa8.73□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF609O15014 1411 aa8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 FKBP1BP68106 108 aa8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 GPSM2P81274 684 aa8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKG1Q13976 671 aa8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 PARP10Q53GL7 1025 aa8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC10A5Q5PT55 438 aa8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 NBPF3Q9H094 633 aa8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 IFT57Q9NWB7 429 aa8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 OTOFQ9HC10 1997 aa8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-201ENST00000264640 ANXA1P04083 346 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 SREBF2Q12772 1141 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 ITPRIPQ8IWB1 547 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 CD99L2Q8TCZ2 262 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGAP45Q92619 1136 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 VIL1P09327 827 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 MAP3K9P80192 1104 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 CAP1Q01518 475 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 PROSER3Q2NL68 480 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 SSH1Q8WYL5 1049 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 FZD1Q9UP38 647 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 PTPN22Q9Y2R2 807 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 ECM29Q5VYK3 1845 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 RLBP1P12271 317 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM27P14373 513 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 TCIRG1Q13488 830 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 NBPF9Q3BBW0 867 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 NLRP10Q86W26 655 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 ARMC5Q96C12 935 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 MYOZ2Q9NPC6 264 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 SPRYD7Q5W111 196 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 TMC4Q7Z404 712 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 TBC1D16Q8TBP0 767 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 EYA3Q99504 573 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 SH3TC1Q8TE82 1336 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 UFL1O94874 794 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 SASH1O94885 1247 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 USP17L8P0C7I0 530 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 CRHR2Q13324 411 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 SKAP1Q86WV1 359 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 NECTIN2Q92692 538 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 ERO1AQ96HE7 468 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF333Q96JL9 665 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 MXD3Q9BW11 206 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 EFCC1Q9HA90 598 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 LAMA3Q16787 3333 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 UNC80Q8N2C7 3258 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.3 ms