RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	AMY1A	P04745	511 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	HTR1D	P28221	377 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	CD38	P28907	300 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	TAF10	Q12962	218 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072		Q6ZT83	130 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	C16orf92	Q96LL3	132 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	ST20	Q9HBF5	79 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	RNF181	Q9P0P0	153 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		5.21	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	FRG2C	A6NGY1	282 aa		5.21	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	ANGPTL7	O43827	346 aa		5.21	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	CYBA	P13498	195 aa		5.21	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	PI3	P19957	117 aa		5.21	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	CTRL	P40313	264 aa		5.21	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	5.21	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		5.21	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	FRG2	Q64ET8	278 aa		5.21	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		5.21	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072		Q8NA96	180 aa		5.21	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	PPTC7	Q8NI37	304 aa		5.21	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	FRG2B	Q96QU4	278 aa		5.21	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		5.21	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	CKLF	Q9UBR5	152 aa		5.21	□□□□□ -1.57
NECAP1-222	ENST00000640072	LRRC30	A6NM36	301 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072		K7EP34	96 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	NEURL1	O76050	574 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	SFT2D2	O95562	160 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	IGFBP2	P18065	325 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	RAB37	Q96AX2	223 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	HES7	Q9BYE0	225 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	CMC2	Q9NRP2	79 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	C15orf65	H3BRN8	121 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072		K7N7A8	449 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	YPEL1	O60688	119 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	OR2H2	O95918	312 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	LGALS2	P05162	132 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	FGF1	P05230	155 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	H2BFM	P0C1H6	154 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	SGSH	P51688	502 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	ADIG	Q0VDE8	80 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	PMVK	Q15126	192 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072		Q6ZVL8	140 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM86B	Q8N661	226 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	YPEL2	Q96QA6	119 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	FBXL15	Q9H469	300 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	DUSP13	Q9UII6	198 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	GYPB	P06028	91 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF708	P17019	499 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	PPP1CA	P62136	330 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	C1orf61	Q13536	156 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF695	Q8IW36	515 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	BANF2	Q9H503	90 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	FOXF1	Q12946	379 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	OR4C12	Q96R67	309 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072		E9PLN8	166 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	NPFF	O15130	113 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	DHH	O43323	396 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	SPRY2	O43597	315 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF728	P0DKX0	622 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	IRF1	P10914	325 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	IL3RA	P26951	378 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	ADM	P35318	185 aa		5.2	□□□□□ -1.58

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