RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	RYR3	Q15413	4870 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	TENM3	Q9P273	2699 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	MSGN1	A6NI15	193 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	AIRE	O43918	545 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	PROP1	O75360	226 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	OR2A4	O95047	310 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	DIRAS3	O95661	229 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	CRYZL1	O95825	349 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	GSTT2	P0CG29	244 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	GSTT2B	P0CG30	244 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	CD37	P11049	281 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	ARL6IP1	Q15041	203 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM177	Q53S58	311 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	GFI1	Q99684	422 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	MGLL	Q99685	303 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	DPPA5	A6NC42	116 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM223B	A6NKX1	122 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	IGLV2-23	P01705	113 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	OR9G9	P0C7N8	305 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	GNB3	P16520	340 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	AQP4	P55087	323 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	UBE2K	P61086	200 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	FABP5	Q01469	135 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	ATP5G2	Q06055	141 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	IRF3	Q14653	427 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599		Q8N1Y9	231 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	TEX45	Q8NA69	505 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	SPIN2A	Q99865	258 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	VCX3B	Q9H321	246 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	COL7A1	Q02388	2944 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	LCE6A	A0A183	80 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	SHISA3	A0PJX4	238 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	TPPP	O94811	219 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	BRI3	O95415	125 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	CD36	P16671	472 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	RHOG	P84095	191 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	DYRK1A	Q13627	763 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM209B	Q5JX69	171 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	IL17D	Q8TAD2	202 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599		J3QRK9	145 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	JTB	O76095	146 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	CRYGB	P07316	175 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	RAB6A	P20340	208 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	MAP2K4	P45985	399 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	CD81	P60033	236 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	PRSS8	Q16651	343 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	HAGH	Q16775	308 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	DUSP21	Q9H596	190 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	IFITM5	A6NNB3	132 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	MFNG	O00587	321 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	FCGR3B	O75015	233 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC22A5	O76082	557 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	TRBV12-3	P01733	135 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	CSN3	P07498	182 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	CTXN2	P0C2S0	81 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	RAB3B	P20337	219 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	CDK10	Q15131	360 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	GUCA2B	Q16661	112 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	KCTD9	Q7L273	389 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	MMD2	Q8IY49	270 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	DHFR	P00374	187 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	DTYMK	P23919	212 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-231	ENST00000639599	OR10A3	P58181	314 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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