RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636905.1

SYNGAP1-218, Transcript of synaptic Ras GTPase activating protein 1, human

TSL 5

Gene SYNGAP1, Length 123 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SYNGAP1-218	ENST00000636905	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905		B8ZZF3	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	DVL1	O14640	695 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	SLC31A2	O15432	143 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	HBE1	P02100	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	APOC3	P02656	99 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	AGA	P20933	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	SNCA	P37840	140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	RAB2A	P61019	212 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	GNB2	P62879	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	RELB	Q01201	579 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	TLE4	Q04727	773 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	TFF3	Q07654	80 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	LY6D	Q14210	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	ZNF273	Q14593	569 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	PEA15	Q15121	130 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	LYG1	Q8N1E2	194 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	ZNF525	Q8N782	197 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	DTD1	Q8TEA8	209 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905		A0A087X0M5	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905		A0A1B0GX30	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905		A0A1W2PPH5	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905		F8W036	122 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905		H3BP45	60 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	SIAH2	O43255	324 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	SOX15	O60248	233 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	MMP23A	O75900	390 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	SNAPIN	O95295	136 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	IFNA17	P01571	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	COL8A2	P25067	703 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	DLX6	P56179	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	LINC00205	P59089	165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	ZNF616	Q08AN1	781 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	GUK1	Q16774	197 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	C4orf17	Q53FE4	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	SVBP	Q8N300	66 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	TNFRSF14	Q92956	283 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNGAP1-218	ENST00000636905	RHOV	Q96L33	236 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms