RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 PSG5Q15238 335 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 MSMO1Q15800 293 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 KCTD9Q7L273 389 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM17Q86X19 198 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 BVESQ8NE79 360 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 OR6F1Q8NGZ6 308 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 BORCS5Q969J3 196 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 MOB3AQ96BX8 217 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 GPHA2Q96T91 129 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 SOSTQ9BQB4 213 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 FBXL15Q9H469 300 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 TAS2R8Q9NYW2 309 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 KIAA1456Q9P272 454 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 PLXNB1O43157 2135 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 FABP12A6NFH5 140 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 KCNAB3O43448 404 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 TNFSF12O43508 249 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 FBXO24O75426 580 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLV2-23P01705 113 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 CD3DP04234 171 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 GNRHRP30968 328 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 HERV-K104P61576 105 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 RTL8BQ17RB0 113 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM177Q53S58 311 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 VAX1Q5SQQ9 334 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 LIN54Q6MZP7 749 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 FOXRED2Q8IWF2 684 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 STPG2Q8N412 459 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 OR5AU1Q8NGC0 362 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 SGMS2Q8NHU3 365 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 SMIM4Q8WVI0 70 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 RABL2BQ9UNT1 228 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 PSMB11A5LHX3 300 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 M0QYG6 137 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 AP4M1O00189 453 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 FCN1O00602 326 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC25A17O43808 307 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 FCGR3BO75015 233 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 SPDEFO95238 335 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 CRYZL1O95825 349 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 IGF1P05019 195 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 RRASP10301 218 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 LGALS7P47929 136 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 TSPAN5P62079 268 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 ACTBL2Q562R1 376 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF66Q6ZN08 573 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF329Q86UD4 541 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 CHPT1Q8WUD6 406 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 HARBI1Q96MB7 349 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 FXYD6Q9H0Q3 95 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 V9GYH0 126 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 SHOXO15266 292 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 CD74P04233 296 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 CRYGBP07316 175 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 TBPP20226 339 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 CD40LGP29965 261 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 PPP5CP53041 499 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 TAS2R19P59542 299 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 CX3CL1P78423 397 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 NDPQ00604 133 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 CD83Q01151 205 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF45Q02386 682 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 CBX3Q13185 183 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 PLGLAQ15195 96 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 PRR31Q5SQ13 230 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 AADACL3Q5VUY0 350 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM229BQ8NBD8 167 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 OR4D10Q8NGI6 311 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 OR51J1Q9H342 316 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 ATP6V0E1O15342 81 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 RAMP3O60896 148 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 IFITM3Q01628 133 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 CFHR3Q02985 330 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF79Q15937 498 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms