RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603232.6

CELF4-223, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CELF4, Length 1,906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-223	ENST00000603232	RAC2	P15153	192 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	FOXF2	Q12947	444 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	OR4X1	Q8NH49	305 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	SMPD2	O60906	423 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	VWC2	Q2TAL6	325 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	RBKS	Q9H477	322 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	CCL21	O00585	134 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	DVL1	O14640	695 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	SLC31A2	O15432	143 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	KBTBD11	O94819	623 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	RNF224	P0DH78	156 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	SELE	P16581	610 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	PPP1CB	P62140	327 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	LHX4	Q969G2	390 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	S100PBP	Q96BU1	408 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	LRRC30	A6NM36	301 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	CATR1	Q13166	79 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232		A0A087X0M5	115 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232		A0A1B0GX30	115 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	OOEP	A6NGQ2	149 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	SOX15	O60248	233 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	NXPH2	O95156	264 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	IGKV1D-33	P01593	117 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	IGKV1-33	P01594	117 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	CASP6	P55212	293 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	C4orf17	Q53FE4	359 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	GALM	Q96C23	342 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	PRO1933	Q9H354	126 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232		A0A0G2JNJ9	132 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	RAB29	O14966	203 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	ST8SIA5	O15466	376 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	CLDN1	O95832	211 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	HAND1	O96004	215 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	AMBP	P02760	352 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	PSMB3	P49720	205 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	VWA1	Q6PCB0	445 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	SSX9	Q7RTT3	188 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	WDR31	Q8NA23	367 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232		Q9UFV3	132 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	SMCO3	A2RU48	225 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	CDIPT	O14735	213 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	CLDN14	O95500	239 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	GZMB	P10144	247 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	SELL	P14151	372 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	TAS2R60	P59551	318 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	ACSM6	Q6P461	480 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	PRR18	Q8N4B5	295 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	SNX22	Q96L94	193 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	C12orf49	Q9H741	205 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CELF4-223	ENST00000603232	ODAM	A1E959	279 aa		12.84	□□□□□ -0.35

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