RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-231	ENST00000600201	IGLV1-51	P01701	117 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	C22orf42	Q6IC83	251 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	SHOX	O15266	292 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	CNIH1	O95406	144 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	SYNJ2BP	P57105	145 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM177	Q53S58	311 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	CASC10	Q5T4H9	136 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	OR4C12	Q96R67	309 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	GPHA2	Q96T91	129 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	GHITM	Q9H3K2	345 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	CRYZL1	O95825	349 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF45	Q02386	682 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	MUC7	Q8TAX7	377 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	COA4	Q9NYJ1	87 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	IGLV2-14	P01704	120 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	RAB3B	P20337	219 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	SERPINB10	P48595	397 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	ARFRP1	Q13795	201 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	TNXA	Q16473	311 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	STUB1	Q9UNE7	303 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	MSGN1	A6NI15	193 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201		E7EUB6	86 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	C3orf84	H3BNL1	204 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	SSX5	O60225	188 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	CSN3	P07498	182 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	PTHLH	P12272	177 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	MYOD1	P15172	320 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	RAB6A	P20340	208 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	PRSS8	Q16651	343 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	GINS4	Q9BRT9	223 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201		A0A1B0GW64	132 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM235	A6NFC5	223 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201		H3BUA1	57 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	PDCD5	O14737	125 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	MYL9	P24844	172 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	LGALS7	P47929	136 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	PHB2	Q99623	299 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	RETN	Q9HD89	108 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	ERICH4	A6NGS2	130 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-231	ENST00000600201	HMX3	A6NHT5	357 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-231	ENST00000600201	BMPR1B	O00238	502 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-231	ENST00000600201	FCGR3B	O75015	233 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-231	ENST00000600201	GADD45A	P24522	165 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-231	ENST00000600201	CD40LG	P29965	261 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-231	ENST00000600201	UBE2K	P61086	200 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-231	ENST00000600201	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-231	ENST00000600201	RTL8B	Q17RB0	113 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-231	ENST00000600201	CDNF	Q49AH0	187 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-231	ENST00000600201	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-231	ENST00000600201	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-231	ENST00000600201	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		11.27	□□□□□ -0.61

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