RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-215	ENST00000589825	SSX5	O60225	188 aa		12.53	□□□□□ -0.4
EFTUD2-215	ENST00000589825	CRYZL1	O95825	349 aa		12.53	□□□□□ -0.4
EFTUD2-215	ENST00000589825	HLA-DQB1	P01920	261 aa		12.53	□□□□□ -0.4
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF616	Q08AN1	781 aa		12.53	□□□□□ -0.4
EFTUD2-215	ENST00000589825	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		12.53	□□□□□ -0.4
EFTUD2-215	ENST00000589825	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		12.53	□□□□□ -0.4
EFTUD2-215	ENST00000589825	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		12.53	□□□□□ -0.4
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		12.53	□□□□□ -0.4
EFTUD2-215	ENST00000589825	YIPF6	Q96EC8	236 aa		12.53	□□□□□ -0.4
EFTUD2-215	ENST00000589825	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
EFTUD2-215	ENST00000589825	TG	P01266	2768 aa		12.52	□□□□□ -0.4
EFTUD2-215	ENST00000589825	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	CBX5	P45973	191 aa		12.52	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	TPPP2	P59282	170 aa		12.52	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	RUNX1	Q01196	453 aa		12.52	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		12.52	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		12.52	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	KCTD9	Q7L273	389 aa		12.52	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		12.52	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	C5orf30	Q96GV9	206 aa		12.52	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	MS4A10	Q96PG2	267 aa		12.52	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	PHB2	Q99623	299 aa		12.52	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		12.52	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		12.52	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		12.52	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	LINC00473	A8K010	186 aa		12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825		I3L521	148 aa		12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	SOX15	O60248	233 aa		12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	FCGR3B	O75015	233 aa		12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	ACTL6B	O94805	426 aa		12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGLV2-23	P01705	113 aa		12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	TGFBR1	P36897	503 aa		12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	KRTAP10-11	P60412	298 aa		12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	DGCR2	P98153	550 aa		12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	FHL3	Q13643	280 aa		12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	HOGA1	Q86XE5	327 aa		12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	TEX45	Q8NA69	505 aa		12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMEM68	Q96MH6	324 aa		12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	IFT46	Q9NQC8	304 aa		12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	XRCC3	O43542	346 aa		12.5	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	RAMP3	O60896	148 aa		12.5	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	TRGV3	P03979	118 aa		12.5	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	UBE2K	P61086	200 aa		12.5	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		12.5	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		12.5	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		12.5	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	DDB2	Q92466	427 aa		12.5	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	LINC01619	G3V211	115 aa		12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825		H3BUA1	57 aa		12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	MPPED1	O15442	326 aa		12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGHV3-11	P01762	117 aa		12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	FCER2	P06734	321 aa		12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	CRYGB	P07316	175 aa		12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	FCGR2C	P31995	323 aa		12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	TNXA	Q16473	311 aa		12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	POC5	Q8NA72	575 aa		12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR5T1	Q8NG75	326 aa		12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		12.48	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825		A0A0G2JLM5	398 aa		12.48	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		12.48	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		12.48	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825		K7EIL1	84 aa		12.48	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		12.48	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	INSL3	P51460	131 aa		12.48	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		12.48	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		12.48	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		12.48	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR4S2	Q8NH73	311 aa		12.48	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		12.48	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	COA4	Q9NYJ1	87 aa		12.48	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		12.48	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		12.47	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	MSGN1	A6NI15	193 aa		12.47	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	OVOL1	O14753	267 aa		12.47	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	PPY	P01298	95 aa		12.47	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	PTHLH	P12272	177 aa		12.47	□□□□□ -0.41
EFTUD2-215	ENST00000589825	AADAC	P22760	399 aa		12.47	□□□□□ -0.41

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