RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576346.5

NSF-208, Transcript of N-ethylmaleimide sensitive factor, vesicle fusing ATPase, human

TSL 4

Gene NSF, Length 710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSF-208	ENST00000576346	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	CELA2A	P08217	269 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	SCT	P09683	121 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	PGA5	P0DJD9	388 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	CCL4	P13236	92 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	TDGF1	P13385	188 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	NQO2	P16083	231 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	COX5A	P20674	150 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	OMG	P23515	440 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	KIR2DS2	P43631	304 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	FHIT	P49789	147 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	CLDN18	P56856	261 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	OR2B8P	P59922	312 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	RAB11A	P62491	216 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	LCN2	P80188	198 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	TNFRSF9	Q07011	255 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	LY6D	Q14210	128 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	ZNF146	Q15072	292 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	ELOB	Q15370	118 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	HAGH	Q16775	308 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	PCSK4	Q6UW60	755 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	OR5R1	Q8NH85	324 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	NANP	Q8TBE9	248 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	CT55	Q8WUE5	264 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	DYRK2	Q92630	601 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	GALM	Q96C23	342 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	GPR146	Q96CH1	333 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	ACY3	Q96HD9	319 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	FAM210B	Q96KR6	192 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	GGACT	Q9BVM4	153 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	OR51I2	Q9H344	312 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	GNG13	Q9P2W3	67 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	CACNG5	Q9UF02	275 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	MIOX	Q9UGB7	285 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	MGA	Q8IWI9	3026 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	ARID1A	O14497	2285 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346		A0A0G2JMM0	328 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346		A0A1W2PPB8	328 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346		A0A1W2PRS3	328 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	OR5H1	A6NKK0	313 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	ZFP92	A6NM28	416 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	ZNF727	A8MUV8	499 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346		H0YL77	283 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346		H7BYZ3	331 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	IFNL4	K9M1U5	179 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	DVL1	O14640	695 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	RAB29	O14966	203 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	CYB5B	O43169	146 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	3.16	□□□□□ -1.9
NSF-208	ENST00000576346	SYNGR1	O43759	233 aa		3.16	□□□□□ -1.9

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