RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 CYSLTR1Q9Y271 337 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPN3-211ENST00000562199 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPN3-211ENST00000562199 EP400Q96L91 3159 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPN3-211ENST00000562199 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPN3-211ENST00000562199 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPN3-211ENST00000562199 H7C1C5 153 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPN3-211ENST00000562199 K7EPK0 472 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPN3-211ENST00000562199 M0R1B8 84 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPN3-211ENST00000562199 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
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CAPN3-211ENST00000562199 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.56□□□□□ -1.68
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CAPN3-211ENST00000562199 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
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CAPN3-211ENST00000562199 PGLYRP3Q96LB9 341 aa4.56□□□□□ -1.68
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CAPN3-211ENST00000562199 ZNF222Q9UK12 451 aa4.56□□□□□ -1.68
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CAPN3-211ENST00000562199 RFLNAQ6ZTI6 216 aa4.55□□□□□ -1.68
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CAPN3-211ENST00000562199 ZNRF4Q8WWF5 429 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM106AQ96A25 262 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPN3-211ENST00000562199 SLAMF6Q96DU3 332 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF503Q96F45 646 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPN3-211ENST00000562199 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CAPN3-211ENST00000562199 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
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