RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM133Q9H2Q1 129 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 FBXL17Q9UF56 701 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 CRYZL1O95825 349 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGHV2-5P01817 119 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 IAPPP10997 89 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC00311Q8N616 119 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR4S2Q8NH73 311 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR9G1Q8NH87 305 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCARB1Q8WTV0 552 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGSF23A1L1A6 192 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 SYNGR2O43760 224 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 LIPFP07098 398 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 MMP9P14780 707 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 PAX1P15863 534 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 REG1BP48304 166 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 PAX9P55771 341 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 COA4Q9NYJ1 87 aa14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
USP3-AS1-208ENST00000560962 LOC105371242A0A075B767 164 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 TOR1AO14656 332 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 TAAR5O14804 337 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 GSX2Q9BZM3 304 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 H3BP45 60 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR9G9P0C7N8 305 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 TPT1P13693 172 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 NQO2P16083 231 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL8A1P27658 744 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP5J2P56134 94 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAB14P61106 215 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERVK-16P61578 105 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM252Q8N6L7 170 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 STOML3Q8TAV4 291 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 WFDC1Q9HC57 220 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1W2PPE2 198 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1W2PR64 198 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1W2PRV1 198 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 NDUFS8O00217 210 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLLU1Q5K131 121 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 BAP18Q8IXM2 172 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLDND2Q8NHS1 167 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAB40CQ96S21 281 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC25A31Q9H0C2 315 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBKSQ9H477 322 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 COX7A1P24310 79 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR2B8PP59922 312 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBE2KP61086 200 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 LMO4P61968 165 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARF6P62330 175 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNFRSF9Q07011 255 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM168AQ92567 244 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 NRGNQ92686 78 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNFRSF14Q92956 283 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 A8MXK9 166 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM90A26D6RGX4 464 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 CST7O76096 145 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF787Q6DD87 383 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM186Q96B77 213 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM140Q9NV12 185 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 PSENENQ9NZ42 101 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 HSPB7Q9UBY9 170 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRAV3A0A0B4J244 114 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 VWC2LB2RUY7 222 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 M0R1W7 72 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGKV1-16P04430 117 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF137PP52743 207 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 RTL8BQ17RB0 113 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPINK9Q5DT21 86 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM71F2Q6NXP2 309 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q8N7P7 452 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR4A16Q8NH70 328 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLEC7AQ9BXN2 247 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRRX1P54821 245 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLINT1Q14677 625 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLEC2AQ6UVW9 174 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-208ENST00000560962 PNKDQ8N490 385 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms