RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556333.1

RCCD1-205, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RCCD1, Length 735 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-205ENST00000556333 CATR1Q13166 79 aa15.99■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 MSMO1Q15800 293 aa15.99■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 C5orf64Q2M2E5 130 aa15.99■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 LIN54Q6MZP7 749 aa15.99■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 CCDC190Q86UF4 302 aa15.99■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa15.99■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 CLCC1Q96S66 551 aa15.99■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 LINC00527Q9UJ94 153 aa15.99■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 V9GYH0 126 aa15.99■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 KCNAB3O43448 404 aa15.98■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 GNRHRP30968 328 aa15.98■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 PSG5Q15238 335 aa15.98■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa15.98■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 LPCAT3Q6P1A2 487 aa15.98■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 C11orf44Q8N8P7 122 aa15.98■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 OR4D10Q8NGI6 311 aa15.98■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 HSPB9Q9BQS6 159 aa15.98■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 A6NHS1 94 aa15.97■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 LINC01548A6NM66 108 aa15.97■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 WIPF1O43516 503 aa15.97■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 SLC25A17O43808 307 aa15.97■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 CD74P04233 296 aa15.97■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 AKAIN1P0CW23 69 aa15.97■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 PGAM2P15259 253 aa15.97■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 LGALS7P47929 136 aa15.97■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 TMEM177Q53S58 311 aa15.97■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 AADACL3Q5VUY0 350 aa15.97■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 FAAP20Q6NZ36 180 aa15.97■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 CMTM1Q8IZ96 169 aa15.97■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 Q8N402 240 aa15.97■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 ARRDC1Q8N5I2 433 aa15.97■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 OR51H1Q8NH63 302 aa15.97■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 AP4M1O00189 453 aa15.96■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 GPR31O00270 319 aa15.96■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 SPDEFO95238 335 aa15.96■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 HLA-DRB1P01911 266 aa15.96■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 S100GP29377 79 aa15.96■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 MEF2DQ14814 521 aa15.96■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 ZNF79Q15937 498 aa15.96■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 OR5AU1Q8NGC0 362 aa15.96■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 OR4S2Q8NH73 311 aa15.96■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 CHPT1Q8WUD6 406 aa15.96■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 CITED1Q99966 193 aa15.96■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 WNT10AQ9GZT5 417 aa15.96■□□□□ 0.15
RCCD1-205ENST00000556333 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa15.95■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 PSMB11A5LHX3 300 aa15.95■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 DISC1C4P0D8 188 aa15.95■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 FBXO24O75426 580 aa15.95■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 RLN1P04808 185 aa15.95■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 KIR2DS2P43631 304 aa15.95■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 PPP5CP53041 499 aa15.95■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 VMA21Q3ZAQ7 101 aa15.95■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 PHLDA2Q53GA4 152 aa15.95■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 SPAG16Q8N0X2 631 aa15.95■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 POC5Q8NA72 575 aa15.95■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 OR4C16Q8NGL9 310 aa15.95■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 ABHD5Q8WTS1 349 aa15.95■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 PARP11Q9NR21 331 aa15.95■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 BATF3Q9NR55 127 aa15.95■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 ETV6P41212 452 aa15.94■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 UCP3P55916 312 aa15.94■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 CNPY1Q3B7I2 92 aa15.94■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa15.94■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 SLC38A6Q8IZM9 456 aa15.94■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 STPG2Q8N412 459 aa15.94■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 TOMM5Q8N4H5 51 aa15.94■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 RSRP1Q9BUV0 290 aa15.94■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 OR51J1Q9H342 316 aa15.94■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 TPSG1Q9NRR2 321 aa15.94■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa15.93■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 FCN1O00602 326 aa15.93■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 CA2P00918 260 aa15.93■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 IGLV2-23P01705 113 aa15.93■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 CD28P10747 220 aa15.93■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 SLC35B1P78383 322 aa15.93■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 C10orf99Q6UWK7 81 aa15.93■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 ZNF329Q86UD4 541 aa15.93■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 PPP1R27Q86WC6 154 aa15.93■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 OR4X2Q8NGF9 303 aa15.93■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 TERB2Q8NHR7 220 aa15.93■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 GON7Q9BXV9 100 aa15.93■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 MCUBQ9NWR8 336 aa15.93■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 TENM1Q9UKZ4 2725 aa15.93■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 PLXNB1O43157 2135 aa15.92■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 ATP6V0E1O15342 81 aa15.92■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 VDAC1P21796 283 aa15.92■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 INPP1P49441 399 aa15.92■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 AP3S2P59780 193 aa15.92■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 GNB1P62873 340 aa15.92■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 IDO2Q6ZQW0 420 aa15.92■□□□□ 0.14
RCCD1-205ENST00000556333 LHFPL1Q86WI0 220 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms