RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 HAMPP81172 84 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 PDE6HQ13956 83 aa2.72□□□□□ -1.97
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JMJD1C-210ENST00000542921 OR51G1Q8NGK1 321 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 PFN4Q8NHR9 129 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 HIST1H2BAQ96A08 127 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 HAPLN2Q9GZV7 340 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 MMP25Q9NPA2 562 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 SNURFQ9Y675 71 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 E9PLD3 99 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 ACER2Q5QJU3 275 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 KLHDC3Q9BQ90 382 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 CEP152O94986 1710 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 TRGV2A0A075B6R0 118 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM171A2A8MVW0 826 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 USP17L23D6RBM5 183 aa2.72□□□□□ -1.97
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JMJD1C-210ENST00000542921 Q6ZSR9 355 aa2.72□□□□□ -1.97
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JMJD1C-210ENST00000542921 SAXO1Q8IYX7 474 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 DUX3Q96PT4 197 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 CEACAM18A8MTB9 384 aa2.72□□□□□ -1.97
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JMJD1C-210ENST00000542921 UBE2D2P62837 147 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 TAL2Q16559 108 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 C3AR1Q16581 482 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF826PQ6ZT77 177 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 SERP2Q8N6R1 65 aa2.72□□□□□ -1.97
JMJD1C-210ENST00000542921 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP2.72□□□□□ -1.97
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JMJD1C-210ENST00000542921 IMUPQ9GZP8 106 aa2.72□□□□□ -1.97
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JMJD1C-210ENST00000542921 RND2P52198 227 aa2.71□□□□□ -1.97
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JMJD1C-210ENST00000542921 WFDC8Q8IUA0 241 aa2.71□□□□□ -1.97
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JMJD1C-210ENST00000542921 SPSB4Q96A44 273 aa2.71□□□□□ -1.97
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JMJD1C-210ENST00000542921 CALYQ9NYX4 217 aa2.71□□□□□ -1.98
JMJD1C-210ENST00000542921 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa2.71□□□□□ -1.98
JMJD1C-210ENST00000542921 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa2.71□□□□□ -1.98
JMJD1C-210ENST00000542921 CTLA4P16410 223 aa2.71□□□□□ -1.98
JMJD1C-210ENST00000542921 TM4SF1P30408 202 aa2.71□□□□□ -1.98
JMJD1C-210ENST00000542921 BSPH1Q075Z2 132 aa2.71□□□□□ -1.98
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