RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 GRIN2BQ13224 1484 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 MAP3K19Q56UN5 1328 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 A0A087WUU8 490 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa0.41□□□□□ -2.34
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RNU6-344P-201ENST00000516635 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
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RNU6-344P-201ENST00000516635 CDK5R1Q15078 307 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
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RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM42Q69YG0 159 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM45BPQ6NSW5 357 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR13C8Q8NGS7 320 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR10D3Q8NH80 312 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF675Q8TD23 568 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 IMMP2LQ96T52 175 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM109Q9BVC6 243 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 TREM1Q9NP99 234 aa0.41□□□□□ -2.34
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RNU6-344P-201ENST00000516635 C1orf109Q9NX04 203 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 TENM3Q9P273 2699 aa0.41□□□□□ -2.34
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RNU6-344P-201ENST00000516635 HEATR5AQ86XA9 2040 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 BRWD1Q9NSI6 2320 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa0.4□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa0.4□□□□□ -2.35
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RNU6-344P-201ENST00000516635 HMSDA8MTL9 139 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF879B4DU55 563 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 H3BT86 120 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 GOLGA8RI6L899 631 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 KLRC4O43908 158 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPBPP02775 128 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 HLA-DQB2P05538 268 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 UCHL1P09936 223 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 TFPTP0C1Z6 253 aa0.4□□□□□ -2.35
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RNU6-344P-201ENST00000516635 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
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RNU6-344P-201ENST00000516635 SPATA24Q86W54 205 aa0.4□□□□□ -2.35
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RNU6-344P-201ENST00000516635 CRLF3Q8IUI8 442 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 C17orf78Q8N4C9 275 aa0.4□□□□□ -2.35
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RNU6-344P-201ENST00000516635 BBS2Q9BXC9 721 aa0.4□□□□□ -2.35
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RNU6-344P-201ENST00000516635 CST9LQ9H4G1 147 aa0.4□□□□□ -2.35
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RNU6-344P-201ENST00000516635 K7ERQ8 282 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
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RNU6-344P-201ENST00000516635 BTN3A2P78410 334 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 FABP5Q01469 135 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 MIAQ16674 131 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 Q1T7F1 81 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 LRRC26Q2I0M4 334 aa0.39□□□□□ -2.35
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RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM173BQ6P4H8 233 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 LYZL1Q6UWQ5 148 aa0.39□□□□□ -2.35
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