RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513618.1

SPATA20-223, Transcript of spermatogenesis associated 20, human

TSL 2

Gene SPATA20, Length 629 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPATA20-223	ENST00000513618	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	GFI1	Q99684	422 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	SCN3B	Q9NY72	215 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	MSGN1	A6NI15	193 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	FAM223B	A6NKX1	122 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	BET1	O15155	118 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	TRBV12-3	P01733	135 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	CD3G	P09693	182 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	PSMD7	P51665	324 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	UBE2K	P61086	200 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	RCN1	Q15293	331 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	VCX	Q9H320	206 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	TPPP	O94811	219 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	PRSS8	Q16651	343 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	RAB3C	Q96E17	227 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	RAB22A	Q9UL26	194 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	MPPED1	O15442	326 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	TUSC2	O75896	110 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	FCGR3A	P08637	254 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	CD81	P60033	236 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	RHOG	P84095	191 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	DEFA5	Q01523	94 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	ATP5G2	Q06055	141 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	IRF3	Q14653	427 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	TNXA	Q16473	311 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	IGSF11	Q5DX21	431 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618		V9GY05	133 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	ACTL6B	O94805	426 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	GSTT2	P0CG29	244 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	GSTT2B	P0CG30	244 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	APELA	P0DMC3	54 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	GADD45A	P24522	165 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	CLDN12	P56749	244 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	DDB2	Q92466	427 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	NEURL2	Q9BR09	285 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	GINS4	Q9BRT9	223 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	BMPR1B	O00238	502 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	CRYZL1	O95825	349 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	HSMCR30	P0CW71	290 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	NECAP1	Q8NC96	275 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	C5orf30	Q96GV9	206 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	TNC	P24821	2201 aa		13.33	□□□□□ -0.27
SPATA20-223	ENST00000513618	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-223	ENST00000513618	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-223	ENST00000513618	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-223	ENST00000513618	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-223	ENST00000513618	RETN	Q9HD89	108 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-223	ENST00000513618	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-223	ENST00000513618	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-223	ENST00000513618	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-223	ENST00000513618	ZNF785	A8K8V0	405 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SPATA20-223	ENST00000513618	CDK10	Q15131	360 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SPATA20-223	ENST00000513618	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SPATA20-223	ENST00000513618	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SPATA20-223	ENST00000513618		Q6ZS49	121 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SPATA20-223	ENST00000513618	MMD2	Q8IY49	270 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SPATA20-223	ENST00000513618	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SPATA20-223	ENST00000513618	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SPATA20-223	ENST00000513618	LINC00473	A8K010	186 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SPATA20-223	ENST00000513618	LGALS9	O00182	355 aa		13.31	□□□□□ -0.28

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