RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513274.5

COPB2-211, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 3

Gene COPB2, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-211ENST00000513274 HAGHQ16775 308 aa8.73□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 OR4A4PQ8NGN8 299 aa8.73□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.73□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 ISOC1Q96CN7 298 aa8.73□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.73□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 RETNQ9HD89 108 aa8.73□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 KCNK7Q9Y2U2 307 aa8.73□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.73□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 V9GY05 133 aa8.73□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 H0Y980 276 aa8.72□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 H3BUA1 57 aa8.72□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 ARL6IP5O75915 188 aa8.72□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 CSN3P07498 182 aa8.72□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 FCGR3AP08637 254 aa8.72□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 GNB3P16520 340 aa8.72□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 HSPA13P48723 471 aa8.72□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 OR10A3P58181 314 aa8.72□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 CBX3Q13185 183 aa8.72□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 TPBGQ13641 420 aa8.72□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 TATDN3Q17R31 274 aa8.72□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 RPEL1Q2QD12 228 aa8.72□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 ACOT12Q8WYK0 555 aa8.72□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 RAB3CQ96E17 227 aa8.72□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.72□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 SPATA25Q9BR10 227 aa8.72□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 GINS4Q9BRT9 223 aa8.72□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 RAB22AQ9UL26 194 aa8.72□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 TPRKBQ9Y3C4 175 aa8.72□□□□□ -1.01
COPB2-211ENST00000513274 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa8.71□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 A0A0B4J203 849 aa8.71□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 RGS10O43665 173 aa8.71□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 CRYZL1O95825 349 aa8.71□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 AADACP22760 399 aa8.71□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 SERPINB10P48595 397 aa8.71□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 AQP4P55087 323 aa8.71□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 RTL8BQ17RB0 113 aa8.71□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.71□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 TMEM177Q53S58 311 aa8.71□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 ZNF343Q6P1L6 599 aa8.71□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.71□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa8.71□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.71□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 SMIM30A4D0T7 59 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 LINC00473A8K010 186 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 A8MZ25 164 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 IFNA6P05013 189 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 OR9G9P0C7N8 305 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 EDN2P20800 178 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 TALDO1P37837 337 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 ARFRP1Q13795 201 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 TRAM1Q15629 374 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 VMA21Q3ZAQ7 101 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 OR10R2Q8NGX6 335 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 SNAPC3Q92966 411 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 TMEM68Q96MH6 324 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 MGLLQ99685 303 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 DUSP21Q9H596 190 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 AKIP1Q9NQ31 210 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 BLOC1S6Q9UL45 172 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 BIRC6Q9NR09 4857 aa8.7□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 SHISA3A0PJX4 238 aa8.69□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 GADD45AP24522 165 aa8.69□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 CD81P60033 236 aa8.69□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 RHOGP84095 191 aa8.69□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 ATP5G2Q06055 141 aa8.69□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 PRSS8Q16651 343 aa8.69□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.69□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 LCN12Q6JVE5 192 aa8.69□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 C19orf35Q6ZS72 473 aa8.69□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 Q8N402 240 aa8.69□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 NRG4Q8WWG1 115 aa8.69□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 USMG5Q96IX5 58 aa8.69□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.69□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 Q9H521 79 aa8.69□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 HMX3A6NHT5 357 aa8.68□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 PPP5D1E7EU14 171 aa8.68□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 RAB27BO00194 218 aa8.68□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 BMPR1BO00238 502 aa8.68□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 MFNGO00587 321 aa8.68□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 FCGR3BO75015 233 aa8.68□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 TUSC2O75896 110 aa8.68□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 OR2J3O76001 311 aa8.68□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 ACTL6BO94805 426 aa8.68□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 IGHV3-23P01764 117 aa8.68□□□□□ -1.02
COPB2-211ENST00000513274 CD7P09564 240 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms