RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF329	Q86UD4	541 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR52I2	Q8NH67	350 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR51J1	Q9H342	316 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	KLK11	Q9UBX7	282 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	PLXNB1	O43157	2135 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	CCDC160	A6NGH7	325 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	FCN1	O00602	326 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	KCTD9	Q7L273	389 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	COMMD1	Q8N668	190 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	MCFD2	Q8NI22	146 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	MOB3A	Q96BX8	217 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	SOST	Q9BQB4	213 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	GON7	Q9BXV9	100 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	GABARAP	H6UMI1	98 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	GNRHR	P30968	328 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	TNFSF8	P32971	234 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC35B1	P78383	322 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	CX3CL1	P78423	397 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	NDP	Q00604	133 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	MFSD4A	Q8N468	514 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	HARBI1	Q96MB7	349 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	CTDSPL	O15194	276 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	SHOX	O15266	292 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	ATP6V0E1	O15342	81 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC25A17	O43808	307 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	CRYZL1	O95825	349 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	FXYD4	P59646	89 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	CBX3	Q13185	183 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	RNF152	Q8N8N0	203 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	FCGR3B	O75015	233 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGHG4	P01861	327 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	TBP	P20226	339 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	HERV-K104	P61576	105 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	DGCR2	P98153	550 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	PLGLA	Q15195	96 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	ACTBL2	Q562R1	376 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	REC114	Q7Z4M0	266 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM17	Q86X19	198 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	BORCS5	Q969J3	196 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	GPHA2	Q96T91	129 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	CA2	P00918	260 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	CD74	P04233	296 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	ELANE	P08246	267 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	UBE2K	P61086	200 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	TEX38	Q6PEX7	206 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	TEX45	Q8NA69	505 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	PARP11	Q9NR21	331 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131		G3V318	75 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25	6e-8	■■■□□ 15.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	TNFSF12	O43508	249 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	VDAC1	P21796	283 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	FOXE3	Q13461	319 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	IL18	Q14116	193 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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