RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	LINC00473	A8K010	186 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	LGALS7	P47929	136 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	GABARAPL2	P60520	117 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	CBX3	Q13185	183 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	11.25	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	RTL8B	Q17RB0	113 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	CDNF	Q49AH0	187 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM177	Q53S58	311 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	OR4C12	Q96R67	309 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	PHB2	Q99623	299 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	ATP6V1G2	O95670	118 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	CRYZL1	O95825	349 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	SPART	Q8N0X7	666 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	DDB2	Q92466	427 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	COA4	Q9NYJ1	87 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	TNXA	Q16473	311 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	STUB1	Q9UNE7	303 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM235	A6NFC5	223 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	MSGN1	A6NI15	193 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	NOTO	A8MTQ0	251 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618		H3BUA1	57 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	DIRAS3	O95661	229 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	TRBV12-3	P01733	135 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	RRAS	P10301	218 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	GAL	P22466	123 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618		Q6ZS49	121 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	TENM3	Q9P273	2699 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A0G2JLM5	398 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	FCGR3B	O75015	233 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	TUSC2	O75896	110 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	PRH1	P02810	166 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	DTYMK	P23919	212 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	SYNJ2BP	P57105	145 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	UBE2K	P61086	200 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	DYRK1A	Q13627	763 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	PRSS8	Q16651	343 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	HACD4	Q5VWC8	232 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	TEX45	Q8NA69	505 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	RCHY1	Q96PM5	261 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	OR51E2	Q9H255	320 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	TNC	P24821	2201 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	MPPED1	O15442	326 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	SSX5	O60225	188 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	IGLV1-51	P01701	117 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	ZP3	P21754	424 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	GNG2	P59768	71 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	MXD1	Q05195	221 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM68	Q96MH6	324 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	SSR3	Q9UNL2	185 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	OR9G9	P0C7N8	305 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	PTHLH	P12272	177 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	AADAC	P22760	399 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	SDC2	P34741	201 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	ARL6IP1	Q15041	203 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	KCTD9	Q7L273	389 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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