RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487485.1

TOP3B-216, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 3

Gene TOP3B, Length 725 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-216ENST00000487485 PEX14O75381 377 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 IGKV1-16P04430 117 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 RRASP10301 218 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 PGAM2P15259 253 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 CD40LGP29965 261 aa8.5□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 RPS16P62249 146 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
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TOP3B-216ENST00000487485 RELBQ01201 579 aa8.5□□□□□ -1.05
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TOP3B-216ENST00000487485 MARCH1Q8TCQ1 289 aa8.5□□□□□ -1.05
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TOP3B-216ENST00000487485 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa8.49□□□□□ -1.05
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TOP3B-216ENST00000487485 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 C11orf88Q6PI97 169 aa8.49□□□□□ -1.05
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TOP3B-216ENST00000487485 C1QL4Q86Z23 238 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.49□□□□□ -1.05
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TOP3B-216ENST00000487485 OR8H1Q8NGG4 311 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 RNF5Q99942 180 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 CCDC32Q9BV29 185 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.49□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 NAP1L6A6NFF2 107 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
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TOP3B-216ENST00000487485 S100GP29377 79 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 RAG2P55895 527 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
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TOP3B-216ENST00000487485 TMEM177Q53S58 311 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 Q6ZS46 218 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 OR51H1Q8NH63 302 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
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TOP3B-216ENST00000487485 KIAA1456Q9P272 454 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 GPR132Q9UNW8 380 aa8.48□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 RYR3Q15413 4870 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
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TOP3B-216ENST00000487485 RAMP3O60896 148 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 NDUFA3O95167 84 aa8.47□□□□□ -1.05
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TOP3B-216ENST00000487485 KRTAP10-3P60369 221 aa8.47□□□□□ -1.05
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TOP3B-216ENST00000487485 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 C9orf152Q5JTZ5 239 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 SPAG16Q8N0X2 631 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa8.47□□□□□ -1.05
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TOP3B-216ENST00000487485 OR4S2Q8NH73 311 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 HARBI1Q96MB7 349 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 SCGB3A2Q96PL1 93 aa8.47□□□□□ -1.05
TOP3B-216ENST00000487485 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
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