RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481788.1

RBM28-205, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 3

Gene RBM28, Length 1,052 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-205	ENST00000481788	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	TEX12	Q9BXU0	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788		A8MWP6	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788		E9PI62	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788		H3BNX3	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	UBE2C	O00762	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	SLC22A1	O15245	554 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	XRCC3	O43542	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	OCM2	P0CE71	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	CBLN1	P23435	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	RIPK1	Q13546	671 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	PLGLA	Q15195	96 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	RAB29	O14966	203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	CA11	O75493	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	MAS1	P04201	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	HTR1A	P08908	422 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	C8orf88	P0DMB2	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	RAB3A	P20336	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	MC5R	P33032	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	APOC4	P55056	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	TMED1	Q13445	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	FLOT2	Q14254	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	HMGN3	Q15651	99 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788		Q6ZR54	194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	ASB9	Q96DX5	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	NRBF2	Q96F24	287 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	METTL9	Q9H1A3	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788		A0A0B4J203	849 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	PPP5D1	E7EU14	171 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	ITGB1BP1	O14713	200 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	FKBP6	O75344	327 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	OR2C1	O95371	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	PRH1	P02810	166 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	GLA	P06280	429 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	GTF2F2	P13984	249 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	SERPINA2	P20848	420 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	MFAP2	P55001	183 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	RHOG	P84095	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	RCN1	Q15293	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	KLK9	Q2XQG4	91 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	STX19	Q8N4C7	294 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	NEK7	Q8TDX7	302 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	GPER1	Q99527	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM28-205	ENST00000481788	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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