RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 SHISA3A0PJX4 238 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 NUPR2A6NF83 97 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 MSGN1A6NI15 193 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 BMPR1BO00238 502 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC17A2O00624 439 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 SHOXO15266 292 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 CD3GP09693 182 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM50BP56557 158 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 CD81P60033 236 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB11BQ15907 218 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 TATDN3Q17R31 274 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 SNAPC3Q92966 411 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 MND1Q9BWT6 205 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 PECRQ9BY49 303 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2D2Q9H210 308 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 C8orf4Q9NR00 106 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 DNAH2Q9P225 4427 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0B4J203 849 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 BET1O15155 118 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 FABP7O15540 132 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 TPPPO94811 219 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 CDK1P06493 297 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 OR9G9P0C7N8 305 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 SERPINB10P48595 397 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 CLDN12P56749 244 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 RHOGP84095 191 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF45Q02386 682 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 SPHARQ15513 63 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 PRSS8Q16651 343 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 RTL8BQ17RB0 113 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM177Q53S58 311 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 IGSF11Q5DX21 431 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4A4PQ8NGN8 299 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM203Q969S6 136 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 NEURL2Q9BR09 285 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 CABLES2Q9BTV7 478 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 PEMTQ9UBM1 199 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 MUC4Q99102 2169 aa7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF785A8K8V0 405 aa7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 AIREO43918 545 aa7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 PRH1P02810 166 aa7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 CD7P09564 240 aa7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 UBE2KP61086 200 aa7.09□□□□□ -1.27
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SMARCE1-210ENST00000481231 PRR20DP86480 221 aa7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 PRR20BP86481 221 aa7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 PRR20AP86496 221 aa7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 PLA2G7Q13093 441 aa7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 CBX3Q13185 183 aa7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 TNXAQ16473 311 aa7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 LIPKQ5VXJ0 399 aa7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM91Q6ZNR0 172 aa7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 IDO2Q6ZQW0 420 aa7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 LAX1Q8IWV1 398 aa7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 DEFB125Q8N687 156 aa7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 PHB2Q99623 299 aa7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC2A8Q9NY64 477 aa7.09□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1B0GVY2 172 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM223BA6NKX1 122 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 PTGES3LE9PB15 166 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 MPPED1O15442 326 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 TUSC2O75896 110 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 CRYZL1O95825 349 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 FCGR3AP08637 254 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 GSTT2P0CG29 244 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 GSTT2BP0CG30 244 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 RRASP10301 218 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 EDN2P20800 178 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 RPS25P62851 125 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP5G2Q06055 141 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 RCN1Q15293 331 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 MED22Q15528 200 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.08□□□□□ -1.28
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.08□□□□□ -1.28
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