RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 SLX1AQ9BQ83 275 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 IFITM10A6NMD0 228 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 CEACAM4O75871 244 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 ATP5J2P56134 94 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 HERPUD1Q15011 391 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.55□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 ERASQ7Z444 233 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 SNCGO76070 127 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 FAHP16930 419 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 VCX2Q9H322 139 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.55□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 PPIAL4DF5H284 164 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 LMX1BO60663 402 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 TRGC1P0CF51 173 aa6.55□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 CA6P23280 308 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 Q5BKY6 102 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 LYPD6Q86Y78 171 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 OR2V2Q96R30 315 aa6.55□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.55□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 ISLRO14498 428 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 ADAM20O43506 726 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 HLA-DQA1P01909 254 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 STAG3L3P0CL85 134 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 GLI4P10075 376 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 OR3A4PP47883 348 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 RDH5Q92781 318 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 KCNK15Q9H427 330 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.54□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 AGAP20933 346 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 GNLYP22749 145 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 NPBWR2P48146 333 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 LCN2P80188 198 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 QRFPP83859 136 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 MUC15Q8N387 334 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 TM2D1Q9BX74 207 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 REV3LO60673 3130 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 CACNA1CQ13936 2221 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 SNURFLB1AK76 121 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 FOXH1O75593 365 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 NXPH3O95157 252 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 GYPAP02724 150 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 CELA3AP09093 270 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 PATE4P0C8F1 98 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 ZBTB25P24278 435 aa6.54□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 IGFBP7Q16270 282 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 NIT1Q86X76 327 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 IL36GQ9NZH8 169 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.54□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 TRDCB7Z8K6 153 aa6.53□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 OR4A8P0C604 315 aa6.53□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 HTR1DP28221 377 aa6.53□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.53□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.53□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 BATF2Q8N1L9 274 aa6.53□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.53□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 SPSB4Q96A44 273 aa6.53□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 LYZL4Q96KX0 146 aa6.53□□□□□ -1.36
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