RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4X2Q8NGF9 303 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 MYOZ3Q8TDC0 251 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 RAX2Q96IS3 184 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 MIXL1Q9H2W2 232 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 GNB4Q9HAV0 340 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 VCX3AQ9NNX9 186 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 PARP11Q9NR21 331 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 CCL28Q9NRJ3 127 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2W1Q9Y3N9 320 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0A6YYH2 397 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 A6NJ64 397 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV1-40P01703 118 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 NAT1P18440 290 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 FCGR2CP31995 323 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 MC5RP33032 325 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 RFX2P48378 723 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 LUMP51884 338 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP10-11P60412 298 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 PITPNAQ00169 270 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXE3Q13461 319 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ARL6IP1Q15041 203 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ECSCRQ19T08 205 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM177Q53S58 311 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2B11Q5JQS5 317 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX38Q6PEX7 206 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 IDO2Q6ZQW0 420 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 PDPNQ86YL7 162 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 LYSMD2Q8IV50 215 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF645Q8N7E2 425 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF491Q8N8L2 437 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 MINDY2Q8NBR6 621 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4F17Q8NGA8 305 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4F4Q96R69 305 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 P2RX4Q99571 388 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF5Q99942 180 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 GHITMQ9H3K2 345 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 DIABLOQ9NR28 239 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFP57Q9NU63 452 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA1456Q9P272 454 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 A3GALT2U3KPV4 340 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SORL1Q92673 2214 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV41A0A0B4J266 112 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PN81 502 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 E7EUB6 86 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 I3L521 148 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 CTDSP2O14595 271 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 TNFSF12O43508 249 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 FCGR3BO75015 233 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM127O75204 238 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 RBBP9O75884 186 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SCGNO76038 276 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 CRYZL1O95825 349 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 TGP01266 2768 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 PMP2P02689 132 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ELANEP08246 267 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 CTXN2P0C2S0 81 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 PF4V1P10720 104 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 MYOD1P15172 320 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 VDAC1P21796 283 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 CHRNA7P36544 502 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 RORCP51449 518 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 GNB1P62873 340 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35B1P78383 322 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 DEFA5Q01523 94 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXB2Q5VYV0 432 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF562Q6V9R5 426 aa5.44□□□□□ -1.54
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RABGEF1-206ENST00000461017 LFNGQ8NES3 379 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5AP2Q8NGF4 316 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 GPX8Q8TED1 209 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5B12Q96R08 314 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF580Q9UK33 172 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GW64 132 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 CGB1A6NKQ9 187 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 CCL24O00175 119 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SHOXO15266 292 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 RAMP3O60896 148 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 PPYP01298 95 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 APOA1P02647 267 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 APOA2P02652 100 aa5.43□□□□□ -1.54
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