RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.68□□□□□ -0.06
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PTPRF-209ENST00000438120 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa14.66□□□□□ -0.06
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PTPRF-209ENST00000438120 DUX5Q96PT3 197 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-209ENST00000438120 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRF-209ENST00000438120 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 CD99P14209 185 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
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