RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLGLAQ15195 96 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TEX45Q8NA69 505 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DDB2Q92466 427 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM68Q96MH6 324 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IFT46Q9NQC8 304 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SHOXO15266 292 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HPGDSO60760 199 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGLV2-14P01704 120 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CRYGBP07316 175 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ELK1P19419 428 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PSMB8P28062 276 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CD40LGP29965 261 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FCGR2CP31995 323 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KIR2DS2P43631 304 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LINC00205P59089 165 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DYRK1AQ13627 763 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF695Q8IW36 515 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BVESQ8NE79 360 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GPX8Q8TED1 209 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SNAPC3Q92966 411 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FBXL15Q9H469 300 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LINC00473A8K010 186 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM25AB3EWG3 89 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM25CB3EWG5 89 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM25GB3EWG6 89 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FCN1O00602 326 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ATP6V0E1O15342 81 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC25A17O43808 307 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPYP01298 95 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGLV2-23P01705 113 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PF4P02776 101 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PTHLHP12272 177 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AADACP22760 399 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MYCNOSP40205 109 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UBE2KP61086 200 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM65Q6PI78 240 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KCTD9Q7L273 389 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MFSD4AQ8N468 514 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C5orf30Q96GV9 206 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HARBI1Q96MB7 349 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PARP11Q9NR21 331 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SCOCQ9UIL1 159 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 A0A1W2PRX2 142 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NUDT19A8MXV4 375 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 J3QRK9 145 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FCGR3BO75015 233 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CNIH1O95406 144 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BRI3O95415 125 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CRYZL1O95825 349 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HRASP01112 189 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RCVRNP35243 200 aa6.36□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAB9AP51151 201 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms