RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431803.2

CDC42-IT1-201, CDC42 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42-IT1, Length 692 nt, Biotype sense intronic.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GRPEL2Q8TAA5 225 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C5orf30Q96GV9 206 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MS4A10Q96PG2 267 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RCHY1Q96PM5 261 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MGLLQ99685 303 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CABLES2Q9BTV7 478 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ACOT13Q9NPJ3 140 aa7.22□□□□□ -1.25
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 FABP7O15540 132 aa7.21□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGLV1-51P01701 117 aa7.21□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRGV3P03979 118 aa7.21□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CD3GP09693 182 aa7.21□□□□□ -1.26
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 LGALS7P47929 136 aa7.21□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PSMD7P51665 324 aa7.21□□□□□ -1.26
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MOGAT2Q3SYC2 334 aa7.21□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGSF11Q5DX21 431 aa7.21□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OVCH2Q7RTZ1 564 aa7.21□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RAB3CQ96E17 227 aa7.21□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR4C12Q96R67 309 aa7.21□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR2D2Q9H210 308 aa7.21□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.21□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.21□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RAB22AQ9UL26 194 aa7.21□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 A0A0G2JLM5 398 aa7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SHISA3A0PJX4 238 aa7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RAB27BO00194 218 aa7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BET1O15155 118 aa7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZP3P21754 424 aa7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR10A3P58181 314 aa7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SSX1Q16384 188 aa7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM177Q53S58 311 aa7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HES5Q5TA89 166 aa7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 Q6ZS49 121 aa7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 Q8N1Y9 231 aa7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR5T1Q8NG75 326 aa7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MUC7Q8TAX7 377 aa7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HARBI1Q96MB7 349 aa7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM68Q96MH6 324 aa7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.2□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 IFITM5A6NNB3 132 aa7.19□□□□□ -1.26
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 A8MZ25 164 aa7.19□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RGS13O14921 159 aa7.19□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CNIH1O95406 144 aa7.19□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GSTT2P0CG29 244 aa7.19□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GSTT2BP0CG30 244 aa7.19□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GNB3P16520 340 aa7.19□□□□□ -1.26
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 IL34Q6ZMJ4 242 aa7.19□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF367Q7RTV3 350 aa7.19□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.19□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DDB2Q92466 427 aa7.19□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.19□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ELOVL1Q9BW60 279 aa7.19□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.19□□□□□ -1.26
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ERICH4A6NGS2 130 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PDCD5O14737 125 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SHOXO15266 292 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RRASP10301 218 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GALP22466 123 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AADACP22760 399 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GADD45AP24522 165 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UBE2KP61086 200 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CBX3Q13185 183 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DYRK1AQ13627 763 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RTL8BQ17RB0 113 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa7.18□□□□□ -1.26
CDC42-IT1-201ENST00000431803 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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