RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBP1P09467 338 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 HNF1AP20823 631 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM120AOSQ5T036 256 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM268Q5VZI3 342 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 CFHR4Q92496 578 aa13.65□□□□□ -0.22
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB18Q9NP72 206 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRR13Q9NZ81 148 aa13.65□□□□□ -0.22
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TOP3BP1-201ENST00000420768 VGLL3A8MV65 326 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 S1PR2O95136 353 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRYZL1O95825 349 aa13.64□□□□□ -0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 IGKV1-16P04430 117 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGKV1D-39P04432 117 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 DYNLT3P51808 116 aa13.64□□□□□ -0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DOCK11Q5JSL3 2073 aa13.63□□□□□ -0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 LY6G6DO95868 133 aa13.62□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM106CPP0CH98 169 aa13.62□□□□□ -0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CHAC2Q8WUX2 184 aa13.62□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 R3HDM4Q96D70 268 aa13.62□□□□□ -0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SEC22AQ96IW7 307 aa13.62□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 AKAP9Q99996 3911 aa13.62□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa13.62□□□□□ -0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MOSP00540 346 aa13.61□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRASP01116 189 aa13.61□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 HOXB5P09067 269 aa13.61□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 PAX6P26367 422 aa13.61□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 SRP14P37108 136 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPS16P62249 146 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 EBI3Q14213 229 aa13.61□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 POU2AF1Q16633 256 aa13.61□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2T10Q8NGZ9 312 aa13.61□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 HARBI1Q96MB7 349 aa13.61□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 MGAT4CQ9UBM8 478 aa13.61□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 MMP24Q9Y5R2 645 aa13.61□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ADAP1O75689 374 aa13.6□□□□□ -0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 IGKV1-33P01594 117 aa13.6□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 G6PCP35575 357 aa13.6□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCGB2A2Q13296 93 aa13.6□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 FCN2Q15485 313 aa13.6□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa13.6□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 GGNBP1Q5YKI7 109 aa13.6□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLEC9AQ6UXN8 241 aa13.6□□□□□ -0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5M8Q8NGP6 311 aa13.6□□□□□ -0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMR3AQ99954 134 aa13.6□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CREBBPQ92793 2442 aa13.6□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 OTOGQ6ZRI0 2925 aa13.6□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOTCH2Q04721 2471 aa13.59□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGKV1-5P01602 117 aa13.59□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC25A6P12236 298 aa13.59□□□□□ -0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFB112Q30KQ8 113 aa13.59□□□□□ -0.23
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