RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409945.1

USP40-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP40, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-202ENST00000409945 GON7Q9BXV9 100 aa5.06□□□□□ -1.6
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USP40-202ENST00000409945 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
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USP40-202ENST00000409945 TMEM138Q9NPI0 162 aa5.06□□□□□ -1.6
USP40-202ENST00000409945 SIRT7Q9NRC8 400 aa5.06□□□□□ -1.6
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USP40-202ENST00000409945 RPS4Y2Q8TD47 263 aa5.05□□□□□ -1.6
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USP40-202ENST00000409945 LINC00312Q9Y6C7 94 aa5.05□□□□□ -1.6
USP40-202ENST00000409945 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa5.04□□□□□ -1.6
USP40-202ENST00000409945 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa5.04□□□□□ -1.6
USP40-202ENST00000409945 TMEM89A2RUT3 159 aa5.04□□□□□ -1.6
USP40-202ENST00000409945 SIRPB1O00241 398 aa5.04□□□□□ -1.6
USP40-202ENST00000409945 PDCD5O14737 125 aa5.04□□□□□ -1.6
USP40-202ENST00000409945 CFC1BP0CG36 223 aa5.04□□□□□ -1.6
USP40-202ENST00000409945 CFC1P0CG37 223 aa5.04□□□□□ -1.6
USP40-202ENST00000409945 TRAPPC2P0DI81 140 aa5.04□□□□□ -1.6
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