RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 SCGB1D2O95969 90 aa16.33■□□□□ 0.2
ODC1-202ENST00000405333 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa16.33■□□□□ 0.2
ODC1-202ENST00000405333 OR11H6Q8NGC7 330 aa16.33■□□□□ 0.2
ODC1-202ENST00000405333 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
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ODC1-202ENST00000405333 HYLS1Q96M11 299 aa16.33■□□□□ 0.2
ODC1-202ENST00000405333 INSIG2Q9Y5U4 225 aa16.33■□□□□ 0.2
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ODC1-202ENST00000405333 MBD2Q9UBB5 411 aa16.31■□□□□ 0.2
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ODC1-202ENST00000405333 MARCH11A6NNE9 402 aa16.31■□□□□ 0.2
ODC1-202ENST00000405333 ODF3BA8MYP8 253 aa16.31■□□□□ 0.2
ODC1-202ENST00000405333 H0YJW9 148 aa16.31■□□□□ 0.2
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ODC1-202ENST00000405333 C9orf62Q8N4C0 152 aa16.3■□□□□ 0.2
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ODC1-202ENST00000405333 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
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ODC1-202ENST00000405333 Q96MF0 132 aa16.3■□□□□ 0.2
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ODC1-202ENST00000405333 SLC35D1Q9NTN3 355 aa16.3■□□□□ 0.2
ODC1-202ENST00000405333 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
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ODC1-202ENST00000405333 AKAP9Q99996 3911 aa16.29■□□□□ 0.2
ODC1-202ENST00000405333 TEX15Q9BXT5 2789 aa16.28■□□□□ 0.2
ODC1-202ENST00000405333 PITX3O75364 302 aa16.28■□□□□ 0.2
ODC1-202ENST00000405333 CXCL2P19875 107 aa16.28■□□□□ 0.2
ODC1-202ENST00000405333 IL3RAP26951 378 aa16.28■□□□□ 0.2
ODC1-202ENST00000405333 HTR1DP28221 377 aa16.28■□□□□ 0.2
ODC1-202ENST00000405333 KIR2DS2P43631 304 aa16.28■□□□□ 0.2
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ODC1-202ENST00000405333 OR1S1Q8NH92 325 aa16.28■□□□□ 0.2
ODC1-202ENST00000405333 RPEQ96AT9 228 aa16.28■□□□□ 0.2
ODC1-202ENST00000405333 RITA1Q96K30 269 aa16.28■□□□□ 0.2
ODC1-202ENST00000405333 REG4Q9BYZ8 158 aa16.28■□□□□ 0.2
ODC1-202ENST00000405333 HSPB11Q9Y547 144 aa16.28■□□□□ 0.2
ODC1-202ENST00000405333 TNCP24821 2201 aa16.28■□□□□ 0.2
ODC1-202ENST00000405333 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa16.27■□□□□ 0.2
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ODC1-202ENST00000405333 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
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ODC1-202ENST00000405333 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa16.27■□□□□ 0.2
ODC1-202ENST00000405333 DMBX1Q8NFW5 382 aa16.27■□□□□ 0.2
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ODC1-202ENST00000405333 TRAV3A0A0B4J244 114 aa16.27■□□□□ 0.19
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ODC1-202ENST00000405333 B4DSR2 109 aa16.27■□□□□ 0.19
ODC1-202ENST00000405333 OR9G9P0C7N8 305 aa16.27■□□□□ 0.19
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ODC1-202ENST00000405333 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa16.27■□□□□ 0.19
ODC1-202ENST00000405333 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa16.27■□□□□ 0.19
ODC1-202ENST00000405333 ZNF546Q86UE3 836 aa16.27■□□□□ 0.19
ODC1-202ENST00000405333 WFDC11Q8NEX6 87 aa16.27■□□□□ 0.19
ODC1-202ENST00000405333 THAP6Q8TBB0 222 aa16.27■□□□□ 0.19
ODC1-202ENST00000405333 SPIN2AQ99865 258 aa16.27■□□□□ 0.19
ODC1-202ENST00000405333 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa16.27■□□□□ 0.19
ODC1-202ENST00000405333 HIF1ANQ9NWT6 349 aa16.27■□□□□ 0.19
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