RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV1-8P0DP01 117 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 COX6B1P14854 86 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 IL3RAP26951 378 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 GNG10P50151 68 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 DLX6P56179 175 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 ERVK-16P61578 105 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 ABHD12Q8N2K0 398 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4S2Q8NH73 311 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 TNFRSF14Q92956 283 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 C5orf30Q96GV9 206 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB40CQ96S21 281 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 CACNG5Q9UF02 275 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 SESN1Q9Y6P5 492 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 ITPR1Q14643 2758 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A087X0M5 115 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GX30 115 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 J3QR06 171 aa8.27□□□□□ -1.09
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RABGGTB-201ENST00000319942 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
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RABGGTB-201ENST00000319942 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 UBA52P62987 128 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
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RABGGTB-201ENST00000319942 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 OR8H3Q8N146 312 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF596Q8TC21 504 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 CCL19Q99731 98 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM133Q9H2Q1 129 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 SYNGR2O43760 224 aa8.26□□□□□ -1.09
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RABGGTB-201ENST00000319942 LY86O95711 162 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 HRASP01112 189 aa8.26□□□□□ -1.09
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RABGGTB-201ENST00000319942 FAM71F2Q6NXP2 309 aa8.26□□□□□ -1.09
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RABGGTB-201ENST00000319942 TSPAN15O95858 294 aa8.26□□□□□ -1.09
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RABGGTB-201ENST00000319942 CT45A6P0DMU7 189 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 CT45A5P0DMU8 189 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 CT45A7P0DMV0 189 aa8.26□□□□□ -1.09
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RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf42Q8N5U0 333 aa8.26□□□□□ -1.09
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RABGGTB-201ENST00000319942 SCARB1Q8WTV0 552 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 ST8SIA2Q92186 375 aa8.26□□□□□ -1.09
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RABGGTB-201ENST00000319942 NARFLQ9H6Q4 476 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0G2JRQ6 117 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 MSGN1A6NI15 193 aa8.25□□□□□ -1.09
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