RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598444.1

ARHGEF1-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARHGEF1, Length 425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF1-215ENST00000598444 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 FABP7O15540 132 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 SLC25A17O43808 307 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 SAP30O75446 220 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 SPDEFO95238 335 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 CNIH1O95406 144 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 CA2P00918 260 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 IGHV3-11P01762 117 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 TRGV3P03979 118 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR8U9P0C7N5 309 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 GSTT2P0CG29 244 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 GSTT2BP0CG30 244 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 GNB3P16520 340 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 GADD45AP24522 165 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 SERPINB10P48595 397 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 HSPA13P48723 471 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR10A3P58181 314 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 TPPP2P59282 170 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 FXYD3Q14802 87 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 SSX1Q16384 188 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 IGSF11Q5DX21 431 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 PDPNQ86YL7 162 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 ASCL2Q99929 193 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 U3KQK5 164 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 A0A0B4J203 849 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 SHISA3A0PJX4 238 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 IFITM5A6NNB3 132 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 FCGR3AP08637 254 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 RAB3BP20337 219 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 MYL9P24844 172 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 TALDO1P37837 337 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 LGALS7P47929 136 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 ARFRP1Q13795 201 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR5T1Q8NG75 326 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 ARPC1AQ92747 370 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 RHOVQ96L33 236 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR2D2Q9H210 308 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 TENM2Q9NT68 2774 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF1-215ENST00000598444 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 ERICH4A6NGS2 130 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 RAB27BO00194 218 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 SHOXO15266 292 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 SPNP16150 400 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 RAB6AP20340 208 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 CBX3Q13185 183 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 C22orf42Q6IC83 251 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 ACSM6Q6P461 480 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 BVESQ8NE79 360 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR4C12Q96R67 309 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 GINS4Q9BRT9 223 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 RAB26Q9ULW5 256 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 SMIM30A4D0T7 59 aa6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 J3QRK9 145 aa6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 MFNGO00587 321 aa6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 DIRAS3O95661 229 aa6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 IGLV2-23P01705 113 aa6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 CRYGBP07316 175 aa6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 RRASP10301 218 aa6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 PITPNAQ00169 270 aa6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 RTL8BQ17RB0 113 aa6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 CDNFQ49AH0 187 aa6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 TMEM177Q53S58 311 aa6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 POC5Q8NA72 575 aa6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.82□□□□□ -1.32
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