RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591848.1

AFG3L2-204, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene AFG3L2, Length 446 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2-204ENST00000591848 CENPOQ9BU64 300 aa13.41□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 SLC35D1Q9NTN3 355 aa13.41□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 NDUFB11Q9NX14 153 aa13.41□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 KCNK7Q9Y2U2 307 aa13.41□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 LINC01619G3V211 115 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 SOX15O60248 233 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 CNIH1O95406 144 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 LY86O95711 162 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 CA2P00918 260 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 IGKV1-16P04430 117 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 FCGR3AP08637 254 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 GSTT2P0CG29 244 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 GSTT2BP0CG30 244 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 GNB3P16520 340 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 LINC00205P59089 165 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 CBX3Q13185 183 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 ARFRP1Q13795 201 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 MOGAT2Q3SYC2 334 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 C19orf54Q5BKX5 351 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 ASPHD1Q5U4P2 390 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 MS4A10Q96PG2 267 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 GINS4Q9BRT9 223 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 TOLLIPQ9H0E2 274 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 GAB2Q9UQC2 676 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 DNAH3Q8TD57 4116 aa13.4□□□□□ -0.26
AFG3L2-204ENST00000591848 SLC25A17O43808 307 aa13.39□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 GALP22466 123 aa13.39□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 LGALS7P47929 136 aa13.39□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 TPPP2P59282 170 aa13.39□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 FXYD3Q14802 87 aa13.39□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 ARL6IP1Q15041 203 aa13.39□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 IGSF11Q5DX21 431 aa13.39□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 ARPC1AQ92747 370 aa13.39□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 OR2D2Q9H210 308 aa13.39□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 SLA2Q9H6Q3 261 aa13.39□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa13.39□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 SORL1Q92673 2214 aa13.39□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa13.38□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 SHISA3A0PJX4 238 aa13.38□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 RAB27BO00194 218 aa13.38□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 SAP30O75446 220 aa13.38□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 DIRAS3O95661 229 aa13.38□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 GABARAPL2P60520 117 aa13.38□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 C22orf42Q6IC83 251 aa13.38□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa13.38□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 CABLES2Q9BTV7 478 aa13.38□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 ATG5Q9H1Y0 275 aa13.38□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 SDHAF2Q9NX18 166 aa13.38□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 MFNGO00587 321 aa13.37□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 IGHV3-11P01762 117 aa13.37□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 TRGV3P03979 118 aa13.37□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 SLURP1P55000 103 aa13.37□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 RTL8BQ17RB0 113 aa13.37□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 GRPEL2Q8TAA5 225 aa13.37□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 MAFIPQ8WZ33 124 aa13.37□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa13.36□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 A0A087WW49 117 aa13.36□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 A0A0B4J203 849 aa13.36□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 SHOXO15266 292 aa13.36□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 RRASP10301 218 aa13.36□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP13.36□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 BVESQ8NE79 360 aa13.36□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 OR5T1Q8NG75 326 aa13.36□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 RHOVQ96L33 236 aa13.36□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 TMEM68Q96MH6 324 aa13.36□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 Q9H521 79 aa13.36□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa13.35□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 PSMB9P28065 219 aa13.35□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 PITPNAQ00169 270 aa13.35□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 CDNFQ49AH0 187 aa13.35□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 ADTRPQ96IZ2 230 aa13.35□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 HARBI1Q96MB7 349 aa13.35□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 OR4C12Q96R67 309 aa13.35□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 TPSG1Q9NRR2 321 aa13.35□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa13.35□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 U3KQK5 164 aa13.35□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 A0A0G2JLM5 398 aa13.34□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 SMIM30A4D0T7 59 aa13.34□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 NOTOA8MTQ0 251 aa13.34□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 IGLV2-23P01705 113 aa13.34□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 TMEM177Q53S58 311 aa13.34□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 UBE2UQ5VVX9 321 aa13.34□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 Q6ZS49 121 aa13.34□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 TPRA1Q86W33 373 aa13.34□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 SPARTQ8N0X7 666 aa13.34□□□□□ -0.27
AFG3L2-204ENST00000591848 POC5Q8NA72 575 aa13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 217.7 ms