RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 TGFBR2P37173 567 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 DLX1P56177 255 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 PPP3R1P63098 170 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 PAX8Q06710 450 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
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ATG4D-210ENST00000588972 MKXQ8IYA7 352 aa6.07□□□□□ -1.44
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ATG4D-210ENST00000588972 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 MGLLQ99685 303 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 RDH8Q9NYR8 311 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 CKLFQ9UBR5 152 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 AUP1Q9Y679 476 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 SIRPB1O00241 398 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 MAGEB3O15480 346 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 SC5DO75845 299 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 HAND1O96004 215 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 GPR183P32249 361 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 PAX9P55771 341 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 FGF12P61328 243 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 ARF6P62330 175 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 TPBGQ13641 420 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 SSX1Q16384 188 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 HOGA1Q86XE5 327 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 Q8IYB0 196 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF561Q8N587 486 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 OR4M1Q8NGD0 313 aa6.06□□□□□ -1.44
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ATG4D-210ENST00000588972 CHST6Q9GZX3 395 aa6.06□□□□□ -1.44
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ATG4D-210ENST00000588972 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF737O75373 536 aa6.05□□□□□ -1.44
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ATG4D-210ENST00000588972 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
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ATG4D-210ENST00000588972 UCHL1P09936 223 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 SERPINA2P20848 420 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 OMGP23515 440 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 GABRR1P24046 479 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 PSMB9P28065 219 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 ALDH3B2P48448 385 aa6.05□□□□□ -1.44
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ATG4D-210ENST00000588972 ZNF146Q15072 292 aa6.05□□□□□ -1.44
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ATG4D-210ENST00000588972 PIGYQ3MUY2 71 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 PDZD9Q8IXQ8 264 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 TPRX1Q8N7U7 411 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4D-210ENST00000588972 OR4D6Q8NGJ1 314 aa6.05□□□□□ -1.44
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