RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.631e-6■■■□□ 15.5
CAPNS1-206ENST00000588815 C5orf51A6NDU8 294 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 CCSO14618 274 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 TOX4O94842 621 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 SIX6O95475 246 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 DCAF12L2Q5VW00 463 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 PNKDQ8N490 385 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 NMES1Q9C002 83 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 MSMBP08118 114 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 PAX8Q06710 450 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 GGNBP1Q5YKI7 109 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 LYZL2Q7Z4W2 148 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM25EA8MYX2 175 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 TXNL1O43396 289 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 GATA3P23771 443 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 COX7A1P24310 79 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 C2orf50Q96LR7 162 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 PCGF1Q9BSM1 259 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 CHIAQ9BZP6 476 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNRD1Q9P1U0 126 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 LPAR6P43657 344 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4P4Q8NGL7 312 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 SPIN2AQ99865 258 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHA2Q9HB19 425 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV20A0A0B4J274 112 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 ODF3BA8MYP8 253 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 HPRT1P00492 218 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 C1QBP02746 253 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 CT45A6P0DMU7 189 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 CT45A5P0DMU8 189 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 CT45A7P0DMV0 189 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 RRASP10301 218 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 BRWD1-AS2P59051 145 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 HCP5Q6MZN7 132 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4S2Q8NH73 311 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 REG4Q9BYZ8 158 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 LPAR2Q9HBW0 351 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 CEACAM3P40198 252 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF383Q8NA42 475 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2T35Q8NGX2 323 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 COMMD9Q9P000 198 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 RAMP3O60896 148 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 FCGR3BO75015 233 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 ARG1P05089 322 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 HTR1DP28221 377 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 DLX1P56177 255 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 FGL1Q08830 312 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFP69Q49AA0 526 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM219AQ8IW50 185 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC01356Q8N9X3 169 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10C1Q96KK4 312 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 TBX15Q96SF7 602 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXC2Q99958 501 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV1-39P01597 117 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 APOA2P02652 100 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV1D-39P04432 117 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A6P12236 298 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 RTL8BQ17RB0 113 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 NMSQ5H8A3 153 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 SEC22AQ96IW7 307 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 Q96MF0 132 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 LEUTXA8MZ59 168 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2E1P51965 193 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2B11Q5JQS5 317 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5AN1Q8NGI8 311 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 DPM3Q9P2X0 92 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 MPTX1A8MV57 137 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 LY6LH3BQJ8 138 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 MC5RP33032 325 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 AKR1C2P52895 323 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00205P59089 165 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 MINOS1Q5TGZ0 78 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 NABP2Q9BQ15 211 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF223E7ERA6 249 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 EPHA1P21709 976 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 RPEQ96AT9 228 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC35D1Q9NTN3 355 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 UNC79Q9P2D8 2635 aa25.17■■□□□ 1.62
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