RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568566.5

TSC2-223, Transcript of TSC complex subunit 2, human

TSL 3

Gene TSC2, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSC2-223	ENST00000568566	PPP5C	P53041	499 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	FXYD4	P59646	89 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	PITPNA	Q00169	270 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	IL18	Q14116	193 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	KIR2DS1	Q14954	304 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	STEAP3	Q658P3	488 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566		Q8N6K4	173 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	GINS4	Q9BRT9	223 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	CCDC32	Q9BV29	185 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	OR2D2	Q9H210	308 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	RAB18	Q9NP72	206 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	IFT46	Q9NQC8	304 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	EHF	Q9NZC4	300 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566		A0A1W2PRX2	142 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	FABP12	A6NFH5	140 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	OR5H14	A6NHG9	310 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566		M0R1X1	148 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	TNFSF12	O43508	249 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	CD3D	P04234	171 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	CD33	P20138	364 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	DYNLT3	P51808	116 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	ARL6IP1	Q15041	203 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	CDK10	Q15131	360 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	BAK1	Q16611	211 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	MFSD4A	Q8N468	514 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF702P	Q9H963	129 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566		H0YJW9	148 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	FCN1	O00602	326 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	ITGB1BP1	O14713	200 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	RGS11	O94810	467 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	PPY	P01298	95 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	IGKV1-16	P04430	117 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	PI3	P19957	117 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	CEACAM3	P40198	252 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	CBX5	P45973	191 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	GPR12	P47775	334 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	ARPC4	P59998	168 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	KRTAP10-11	P60412	298 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	CD69	Q07108	199 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	DYRK1A	Q13627	763 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	EBI3	Q14213	229 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	HES1	Q14469	280 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	PYDC2	Q56P42	97 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	TMEM17	Q86X19	198 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	BVES	Q8NE79	360 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	SRR	Q9GZT4	340 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF221	Q9UK13	617 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	OOSP1	A8MZH6	123 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	GABARAP	H6UMI1	98 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	SULT1C2	O00338	296 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	RAB29	O14966	203 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	RBBP9	O75884	186 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	PF4V1	P10720	104 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	TMEM11	P17152	192 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	CD1B	P29016	333 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	GNRHR	P30968	328 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
TSC2-223	ENST00000568566	RCVRN	P35243	200 aa		6.6	□□□□□ -1.35

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