RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560353.1

APH1B-208, Transcript of aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit, humanhuman

TSL 3

Gene APH1B, Length 672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1B-208ENST00000560353 RPSAP08865 295 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 OR9G9P0C7N8 305 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 RAB3AP20336 220 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 PRDX6P30041 224 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 ATP6V1E1P36543 226 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 EFNB1P98172 346 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 PJVKQ0ZLH3 352 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 RIPK1Q13546 671 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 OR4A47Q6IF82 309 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 Q6ZR54 194 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 CENPSQ8N2Z9 138 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 NECAP1Q8NC96 275 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 TMEM163Q8TC26 289 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 GALMQ96C23 342 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 S100A13Q99584 98 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 UBQLN2Q9UHD9 624 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 STEAP1Q9UHE8 339 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.52□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.51□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 OR4C45A6NMZ5 311 aa7.51□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 A8MWP6 167 aa7.51□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 DEFB4AO15263 64 aa7.51□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 IGKV1-16P04430 117 aa7.51□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 APELAP0DMC3 54 aa7.51□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 GTF2F2P13984 249 aa7.51□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 PRKACGP22612 351 aa7.51□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.51□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 RAB12Q6IQ22 244 aa7.51□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 BTNL8Q6UX41 500 aa7.51□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 MARC2Q969Z3 335 aa7.51□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 CCDC140Q96MF4 163 aa7.51□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 IL4I1Q96RQ9 567 aa7.51□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 PHB2Q99623 299 aa7.51□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.5□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 FAM90A7PA6NKC0 464 aa7.5□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 EPM2AB3EWF7 344 aa7.5□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 M0R129 80 aa7.5□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 GPX5O75715 221 aa7.5□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 FAM107AO95990 144 aa7.5□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 IFNA10P01566 189 aa7.5□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 HTR1AP08908 422 aa7.5□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 RAP2AP10114 183 aa7.5□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 SERPINA2P20848 420 aa7.5□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 HLA-DMBP28068 263 aa7.5□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 ZNF85Q03923 595 aa7.5□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.5□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 GLT8D1Q68CQ7 371 aa7.5□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 ZNF529Q6P280 563 aa7.5□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 DNAJC9Q8WXX5 260 aa7.5□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 FAM46BQ96A09 425 aa7.5□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.5□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 MYCBP2O75592 4640 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 SLC16A6O15403 523 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 MPPED1O15442 326 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 SC5DO75845 299 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 AMBPP02760 352 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 PRH1P02810 166 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 GLAP06280 429 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 C8orf88P0DMB2 117 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 CAPGP40121 348 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 C15orf32Q32M92 178 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 DHFR2Q86XF0 187 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 PDPNQ86YL7 162 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 HS3ST5Q8IZT8 346 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 SETD9Q8NE22 299 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 OR13C5Q8NGS8 318 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 OR5B3Q8NH48 314 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.49□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.48□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 TSPAN4O14817 238 aa7.48□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 IFNA21P01568 189 aa7.48□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 IFNA17P01571 189 aa7.48□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 APOA2P02652 100 aa7.48□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 CRYGBP07316 175 aa7.48□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 ARL3P36405 182 aa7.48□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 TMED1Q13445 227 aa7.48□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 GPR176Q14439 515 aa7.48□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.48□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 ZNF585BQ52M93 769 aa7.48□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 Q6ZTC4 211 aa7.48□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 CD300LFQ8TDQ1 290 aa7.48□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 ABHD14BQ96IU4 210 aa7.48□□□□□ -1.21
APH1B-208ENST00000560353 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms