RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-229	ENST00000551936	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	FABP7	O15540	132 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	SPDEF	O95238	335 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	FCGR3A	P08637	254 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	SERPINB10	P48595	397 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	HSPA13	P48723	471 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	SLURP1	P55000	103 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	ACTBL2	Q562R1	376 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	IGSF11	Q5DX21	431 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	ZNF429	Q86V71	674 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	RAB3C	Q96E17	227 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	MS4A10	Q96PG2	267 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	IFITM5	A6NNB3	132 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936		M0R1X1	148 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	RAB27B	O00194	218 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	MFNG	O00587	321 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	BET1	O15155	118 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	IGLV2-23	P01705	113 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	APOA2	P02652	100 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	CRYGB	P07316	175 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	OR8U9	P0C7N5	309 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	GNB3	P16520	340 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	RAB6A	P20340	208 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	SLC25A17	O43808	307 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	DIRAS3	O95661	229 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	IGHV3-11	P01762	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	RAB3B	P20337	219 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	GADD45A	P24522	165 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	FXYD3	Q14802	87 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	ACSM6	Q6P461	480 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	ARPC1A	Q92747	370 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	C5orf30	Q96GV9	206 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	OR2D2	Q9H210	308 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	RAB26	Q9ULW5	256 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936		A0A075B6Q4	140 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936		A0A0B4J203	849 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	SAP30	O75446	220 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	LY86	O95711	162 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	GAL	P22466	123 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	MYL9	P24844	172 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	LGALS7	P47929	136 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	TPPP2	P59282	170 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	ASCL2	Q99929	193 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936		U3KQK5	164 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-229	ENST00000551936	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	TRGV3	P03979	118 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	SPN	P16150	400 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	CD40LG	P29965	261 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	TMEM177	Q53S58	311 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	C22orf42	Q6IC83	251 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936		Q6ZS49	121 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	BVES	Q8NE79	360 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	OR5T1	Q8NG75	326 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	SORL1	Q92673	2214 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936		H3BUA1	57 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	GABARAPL2	P60520	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	POC5	Q8NA72	575 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	DDB2	Q92466	427 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	HARBI1	Q96MB7	349 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	SHOX	O15266	292 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	CNIH1	O95406	144 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	ATP6V1G2	O95670	118 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	GP9	P14770	177 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-229	ENST00000551936	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63

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