RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 TATDN3Q17R31 274 aa6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 TRIM16LQ309B1 348 aa6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 LFNGQ8NES3 379 aa6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 YIPF6Q96EC8 236 aa6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 FAM210AQ96ND0 272 aa6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 TNCP24821 2201 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 A0A1B0GVG6 124 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 FCN1O00602 326 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 MYL12BO14950 172 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 SOX15O60248 233 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 LALBAP00709 142 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 APOA2P02652 100 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 CDK1P06493 297 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 CT45A6P0DMU7 189 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 CT45A5P0DMU8 189 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 CT45A7P0DMV0 189 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 CD36P16671 472 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 CELP19835 753 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 ZNF45Q02386 682 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 ST3GAL4Q11206 333 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 HMGN3Q15651 99 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 RHOVQ96L33 236 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 DERL3Q96Q80 235 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 TMED9Q9BVK6 235 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 ZNF221Q9UK13 617 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 HERC1Q15751 4861 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 PKHD1P08F94 4074 aa6.5□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 H0YJW9 148 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 AIREO43918 545 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 SPDEFO95238 335 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 IGLV1-51P01701 117 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 APOA1P02647 267 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 ZBTB25P24278 435 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 CEACAM6P40199 344 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 PPP5CP53041 499 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 DEFA1P59665 94 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 DEFA3P59666 94 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 NDPQ00604 133 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 CBX3Q13185 183 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 FXYD3Q14802 87 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 PSG5Q15238 335 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 CTF1Q16619 201 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 POC5Q8NA72 575 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 OR5T1Q8NG75 326 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 MCFD2Q8NI22 146 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.49□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 H3BUA1 57 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 ITGB1BP1O14713 200 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 CA2P00918 260 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 CD1AP06126 327 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 AADACP22760 399 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 LGALS7P47929 136 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 SPCS2Q15005 226 aa6.48□□□□□ -1.37
TROAP-208ENST00000548817 HAGHQ16775 308 aa6.48□□□□□ -1.37
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