RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 GNB4Q9HAV0 340 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 SSR3Q9UNL2 185 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 SORL1Q92673 2214 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 RAB27BO00194 218 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 SLC25A17O43808 307 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 PROP1O75360 226 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 IGKV1-16P04430 117 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 CBX3Q13185 183 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 FXYD3Q14802 87 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 CDNFQ49AH0 187 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 AKIRIN2Q53H80 203 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 UBE2UQ5VVX9 321 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 PDPNQ86YL7 162 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 ZNF383Q8NA42 475 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 MINDY2Q8NBR6 621 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 LFNGQ8NES3 379 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 FCGR1BQ92637 280 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 MS4A10Q96PG2 267 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 CENPOQ9BU64 300 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 OR2D2Q9H210 308 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 NOTOA8MTQ0 251 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 I3L521 148 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 J3QRK9 145 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 MFNGO00587 321 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 SHOXO15266 292 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 CA2P00918 260 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 GNB1P62873 340 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 NDPQ00604 133 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 ARL6IP1Q15041 203 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 VAX1Q5SQQ9 334 aa7□□□□□ -1.29
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LMO3-222ENST00000540445 TPRA1Q86W33 373 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 BVESQ8NE79 360 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 GRPEL2Q8TAA5 225 aa7□□□□□ -1.29
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LMO3-222ENST00000540445 PRR25Q96S07 402 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 DAPK2Q9UIK4 370 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 SCOCQ9UIL1 159 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 STUB1Q9UNE7 303 aa7□□□□□ -1.29
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LMO3-222ENST00000540445 IGHV3-11P01762 117 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 TRGV3P03979 118 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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LMO3-222ENST00000540445 RUNX1Q01196 453 aa6.99□□□□□ -1.29
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LMO3-222ENST00000540445 DCUN1D4Q92564 292 aa6.99□□□□□ -1.29
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LMO3-222ENST00000540445 B9D2Q9BPU9 175 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.99□□□□□ -1.29
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LMO3-222ENST00000540445 OR51E2Q9H255 320 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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LMO3-222ENST00000540445 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 LINC01619G3V211 115 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 SAP30O75446 220 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 SPDEFO95238 335 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 DIRAS3O95661 229 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 CTXN2P0C2S0 81 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 RRASP10301 218 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 SDC2P34741 201 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 INSL3P51460 131 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
LMO3-222ENST00000540445 SLURP1P55000 103 aa6.98□□□□□ -1.29
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