RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 PPOXP50336 477 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 SPCS3P61009 180 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 TLE1Q04724 770 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 Q6ZRG5 221 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 Q6ZRM9 215 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 SUN5Q8TC36 379 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 PSENENQ9NZ42 101 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 FZR1Q9UM11 496 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 MARCH11A6NNE9 402 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 FAM157AC9JC47 383 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 TNFSF12O43508 249 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 PROP1O75360 226 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 HRASP01112 189 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 CAMLGP49069 296 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 DYNLT3P51808 116 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 ERVK-16P61578 105 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 SSX2Q16385 188 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 PRR18Q8N4B5 295 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 ZNF525Q8N782 197 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 C5orf30Q96GV9 206 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 CLCC1Q96S66 551 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 S1PR3Q99500 378 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 PRORYQ9H606 182 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 TUBA4BQ9H853 241 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 PSG11Q9UQ72 335 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 CFAP54Q96N23 3096 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 HCFC1P51610 2035 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 A0A1W2PPH5 198 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 LINC00473A8K010 186 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 C17orf98A8MV24 154 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 E7EQL1 145 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 KCNAB3O43448 404 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 TSPAN9O75954 239 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 S1PR2O95136 353 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 ARG1P05089 322 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 FAM87AP0C7U9 286 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 SPINK2P20155 84 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 EDDM3BP56851 147 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 EDDM3AQ14507 147 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 VHLLQ6RSH7 139 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 TCF23Q7RTU1 214 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 OR4A5Q8NH83 315 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 TMEM186Q96B77 213 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 R3HDM4Q96D70 268 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 BET1LQ9NYM9 111 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 PRNDQ9UKY0 176 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PACS1-211ENST00000531298 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
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