RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 NCKAP5O14513 1909 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 A0A087WWC5 75 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 OR7C2O60412 319 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 WISP2O76076 250 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 PET100P0DJ07 73 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 RBM11P57052 281 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 CKS1BP61024 79 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 PAX2Q02962 417 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 COMMD1Q8N668 190 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 Q8WTZ3 238 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 SNX22Q96L94 193 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 CACNA1BQ00975 2339 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0B4J2A0 478 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 TNFSF12O43508 249 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV1D-12P01611 117 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV1-2P23083 117 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 GABRA2P47869 451 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 RHOGP84095 191 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 FOXF2Q12947 444 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 OR8B8Q15620 311 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF718Q3SXZ3 478 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF695Q8IW36 515 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 STPG4Q8N801 248 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 OR5A2Q8NGI9 324 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 NINJ1Q92982 152 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 DECR2Q9NUI1 292 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 CACNA1AO00555 2505 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 OR5B21A6NL26 309 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 HSD17B6O14756 317 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 CXCL1P09341 107 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 TIMP3P35625 211 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 EDDM3AQ14507 147 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 VAMP3Q15836 100 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 NRN1LQ496H8 165 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 OR51H1Q8NH63 302 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 RAB1CQ92928 201 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 RBKSQ9H477 322 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 WIPF3A6NGB9 483 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 NXPH3O95157 252 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 BRI3O95415 125 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 OR13C7P0DN81 318 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 KIR2DS4P43632 304 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 UCP2P55851 309 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 KIR2DS1Q14954 304 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 VAX1Q5SQQ9 334 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 BTNL8Q6UX41 500 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 GFRALQ6UXV0 394 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZT83 130 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 GPR146Q96CH1 333 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 SFT2D2O95562 160 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 SERPINE2P07093 398 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 TNFSF4P23510 183 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 CFPP27918 469 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 CHATP28329 748 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 SNCAP37840 140 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 ASCL5Q7RTU5 278 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 GPHA2Q96T91 129 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 GINS3Q9BRX5 216 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 GPR132Q9UNW8 380 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 LILRA1O75019 489 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-208ENST00000519076 PRSS8Q16651 343 aa6.66□□□□□ -1.34
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