RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490716.5

SUPT20H-220, Transcript of SPT20 homolog, SAGA complex component, humanhuman

TSL 5

Gene SUPT20H, Length 3,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20H-220ENST00000490716 PTHLHP12272 177 aa7.15□□□□□ -1.26
SUPT20H-220ENST00000490716 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.15□□□□□ -1.26
SUPT20H-220ENST00000490716 LYG1Q8N1E2 194 aa7.15□□□□□ -1.26
SUPT20H-220ENST00000490716 BVESQ8NE79 360 aa7.15□□□□□ -1.26
SUPT20H-220ENST00000490716 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SUPT20H-220ENST00000490716 NBR2O15453 112 aa7.15□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.15□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 ACOT12Q8WYK0 555 aa7.15□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 MAFIPQ8WZ33 124 aa7.15□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 FXYD6Q9H0Q3 95 aa7.15□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 CTDSPLO15194 276 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 CRYBA1P05813 215 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 MXD1Q05195 221 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 COMMD1Q8N668 190 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 OR2AK2Q8NG84 335 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 H3BMQ9 156 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.275e-8■■■■■ 27
SUPT20H-220ENST00000490716 IL3RAP26951 378 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 SLC6A1P30531 599 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 MC5RP33032 325 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 GNG12Q9UBI6 72 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 A0A075B6Q4 140 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 KCNAB3O43448 404 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 FBXO24O75426 580 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 GNRHRP30968 328 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 C2orf68Q2NKX9 166 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 OR5AP2Q8NGF4 316 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 OR51J1Q9H342 316 aa7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 SULT1C2O00338 296 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 DYRK1AQ13627 763 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 IDNKQ5T6J7 187 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 ZFP57Q9NU63 452 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 TEX22C9J3V5 150 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 CTXN2P0C2S0 81 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 AARDQ4LEZ3 155 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 MOB3AQ96BX8 217 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 ABHD1Q96SE0 405 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 ATP6V0E1O15342 81 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 ARHGDIBP52566 201 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 AKIRIN2Q53H80 203 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 CHPT1Q8WUD6 406 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.13□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 E7EUB6 86 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 THBS3P49746 956 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 UBE2KP61086 200 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 RAX2Q96IS3 184 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 ELANEP08246 267 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 ZNF585BQ52M93 769 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 IL34Q6ZMJ4 242 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 MOB3BQ86TA1 216 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 ISOC1Q96CN7 298 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 RHOVQ96L33 236 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 OR2D2Q9H210 308 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 M0QZ24 198 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 HPGDSO60760 199 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 CBX5P45973 191 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 UCP3P55916 312 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 KRTAP10-11P60412 298 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.12□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 RYR3Q15413 4870 aa7.11□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 ETV6P41212 452 aa7.11□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa7.11□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 TEX45Q8NA69 505 aa7.11□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 NEK7Q8TDX7 302 aa7.11□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 SCOCQ9UIL1 159 aa7.11□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 V9GYH0 126 aa7.11□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 AADACP22760 399 aa7.11□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 CX3CL1P78423 397 aa7.11□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 BEST4Q8NFU0 473 aa7.11□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 RAB2BQ8WUD1 216 aa7.11□□□□□ -1.27
SUPT20H-220ENST00000490716 KLK15Q9H2R5 256 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms