RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 ETV3LQ6ZN32 361 aa9.41□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 CROCCP3Q8IVE0 287 aa9.41□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 SAMD12Q8N8I0 201 aa9.41□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 DUX3Q96PT4 197 aa9.41□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 DIABLOQ9NR28 239 aa9.41□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 TPSG1Q9NRR2 321 aa9.41□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 SLC35D1Q9NTN3 355 aa9.41□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 ZFP57Q9NU63 452 aa9.41□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 ANXA10Q9UJ72 324 aa9.41□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 GAB2Q9UQC2 676 aa9.41□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 FBXO7Q9Y3I1 522 aa9.41□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 A3GALT2U3KPV4 340 aa9.41□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 TRAV41A0A0B4J266 112 aa9.4□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 MEIS3P1A6NDR6 274 aa9.4□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 SLC25A17O43808 307 aa9.4□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 IGHG4P01861 327 aa9.4□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 CTXN2P0C2S0 81 aa9.4□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 IGLL1P15814 213 aa9.4□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 CX3CL1P78423 397 aa9.4□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 DEFB136Q30KP8 78 aa9.4□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 UBE2NLQ5JXB2 153 aa9.4□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 PDPNQ86YL7 162 aa9.4□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 ZNF695Q8IW36 515 aa9.4□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 BVESQ8NE79 360 aa9.4□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 WFDC9Q8NEX5 89 aa9.4□□□□□ -0.9
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NISCH-214ENST00000490425 SLC25A46Q96AG3 418 aa9.4□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
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NISCH-214ENST00000490425 RNF5Q99942 180 aa9.4□□□□□ -0.9
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NISCH-214ENST00000490425 ZNF580Q9UK33 172 aa9.4□□□□□ -0.9
NISCH-214ENST00000490425 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 LINC00473A8K010 186 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 XRCC3O43542 346 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 TMEM127O75204 238 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 CA2P00918 260 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 HLA-DQB1P01920 261 aa9.39□□□□□ -0.91
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NISCH-214ENST00000490425 IGKV1-13P0DP09 117 aa9.39□□□□□ -0.91
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NISCH-214ENST00000490425 LUMP51884 338 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 ARPC4P59998 168 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 ECSCRQ19T08 205 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 HOGA1Q86XE5 327 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 RNF152Q8N8N0 203 aa9.39□□□□□ -0.91
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NISCH-214ENST00000490425 CASTOR1Q8WTX7 329 aa9.39□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
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NISCH-214ENST00000490425 OR2W1Q9Y3N9 320 aa9.39□□□□□ -0.91
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NISCH-214ENST00000490425 DUTP33316 252 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 TAS2R20P59543 309 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 PJVKQ0ZLH3 352 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 TMEM69Q5SWH9 247 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 GPR107Q5VW38 600 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 ZNF645Q8N7E2 425 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 DDB2Q92466 427 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 SNAPC3Q92966 411 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 RAX2Q96IS3 184 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 HARBI1Q96MB7 349 aa9.38□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 SHOXO15266 292 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 SOX15O60248 233 aa9.37□□□□□ -0.91
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NISCH-214ENST00000490425 CRYZL1O95825 349 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 IGLV1-40P01703 118 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 IGLV2-14P01704 120 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 AADACP22760 399 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 FCGR2CP31995 323 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 MYCNOSP40205 109 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 RAB25P57735 213 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 GNB1P62873 340 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 RPL30P62888 115 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 CBX3Q13185 183 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 CTF1Q16619 201 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 RTL8BQ17RB0 113 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 TMEM177Q53S58 311 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 C19orf54Q5BKX5 351 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 OR2B11Q5JQS5 317 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 TMEM65Q6PI78 240 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-214ENST00000490425 PPP1R27Q86WC6 154 aa9.37□□□□□ -0.91
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