RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487565.5

GARNL3-218, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-218ENST00000487565 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 SLC6A1P30531 599 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 CEACAM3P40198 252 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 UBE2E1P51965 193 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 LGALS4P56470 323 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 BAMBIQ13145 260 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 MSMO1Q15800 293 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 MIDNQ504T8 468 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 HCP5Q6MZN7 132 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 LINC00311Q8N616 119 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 RPEQ96AT9 228 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 GPHA2Q96T91 129 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 S1PR3Q99500 378 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 NUDT15Q9NV35 164 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 RNF150Q9ULK6 438 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 CR1P17927 2039 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 MED13LQ71F56 2210 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 RNF212BA8MTL3 300 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 M0R1X1 148 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 GPR31O00270 319 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 RAB29O14966 203 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 TXNL1O43396 289 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 IGLV1-47P01700 117 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 CD99P14209 185 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 HTR1DP28221 377 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 SAA4P35542 130 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 ARHGDIBP52566 201 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 UCP3P55916 312 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 TAS2R31P59538 309 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 TRIM16LQ309B1 348 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 PLA1AQ53H76 456 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 C11orf88Q6PI97 169 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 PLET1Q6UQ28 207 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 DRAM1Q8N682 238 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 GHITMQ9H3K2 345 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 ZMAT4Q9H898 229 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 VSIG4Q9Y279 399 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 ACANP16112 2415 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 A0A0A6YYJ9 748 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 LEUTXA8MZ59 168 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 TNFSF12O43508 249 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 APOA2P02652 100 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 TCRBP04435 133 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 REG1BP48304 166 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 THBS3P49746 956 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF134P52741 427 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF137PP52743 207 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 RND3P61587 244 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 CATR1Q13166 79 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 GAGE13Q4V321 117 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-218ENST00000487565 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
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