RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484908.1

ATP6AP1-208, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, human

TSL 2

Gene ATP6AP1, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	C3orf84	H3BNL1	204 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	LDLRAD4	O15165	306 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TRGV3	P03979	118 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	GP9	P14770	177 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	LINC00205	P59089	165 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	FABP5	Q01469	135 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	MGLL	Q99685	303 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RAB22A	Q9UL26	194 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908		H3BUA1	57 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908		M0R1X1	148 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SLC25A17	O43808	307 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CD3G	P09693	182 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	FXYD3	Q14802	87 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	POC5	Q8NA72	575 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	NRG4	Q8WWG1	115 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OR4C12	Q96R67	309 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	FABP7	O15540	132 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CRHBP	P24387	322 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	LGALS7	P47929	136 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	HES5	Q5TA89	166 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RAB3C	Q96E17	227 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908		A0A0G2JLM5	398 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ERICH4	A6NGS2	130 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	BET1	O15155	118 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CNIH1	O95406	144 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	DIRAS3	O95661	229 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	IGLV2-23	P01705	113 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PLA2G7	Q13093	441 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TMEM68	Q96MH6	324 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RCHY1	Q96PM5	261 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OR2D2	Q9H210	308 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	STUB1	Q9UNE7	303 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TNC	P24821	2201 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PDCD5	O14737	125 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CRYGB	P07316	175 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	FCGR3A	P08637	254 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	GSTT2	P0CG29	244 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	GSTT2B	P0CG30	244 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ZP3	P21754	424 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	GADD45A	P24522	165 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	MAP2K4	P45985	399 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	IGSF11	Q5DX21	431 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OR5T1	Q8NG75	326 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	HARBI1	Q96MB7	349 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	BRI3	O95415	125 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CBX3	Q13185	183 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TMEM177	Q53S58	311 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CENPO	Q9BU64	300 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ZMAT4	Q9H898	229 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	MFNG	O00587	321 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SHOX	O15266	292 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	IGLV1-51	P01701	117 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RRAS	P10301	218 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RAB6A	P20340	208 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SSX1	Q16384	188 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	BVES	Q8NE79	360 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	MUC7	Q8TAX7	377 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	IFITM5	A6NNB3	132 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RAB27B	O00194	218 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	GNB3	P16520	340 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	AADAC	P22760	399 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RTL8B	Q17RB0	113 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATP6AP1-208	ENST00000484908	C5orf30	Q96GV9	206 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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