RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481807.3

MECP2-208, Transcript of methyl-CpG binding protein 2, human

TSL 3

Gene MECP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MECP2-208	ENST00000481807	ATG12	O94817	140 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	IFNA7	P01567	189 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	RLN2	P04090	185 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	NDUFB7	P17568	137 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	COL8A2	P25067	703 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	SMCO1	Q147U7	214 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	ZNF585B	Q52M93	769 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	FAM219A	Q8IW50	185 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	OR1S1	Q8NH92	325 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	DCUN1D4	Q92564	292 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	RAB39B	Q96DA2	213 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	ZNF714	Q96N38	554 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	GPHA2	Q96T91	129 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	COA4	Q9NYJ1	87 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	PSG11	Q9UQ72	335 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	USF3	Q68DE3	2245 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	ARID1A	O14497	2285 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807		A0A087X0M5	115 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807		A0A1B0GX30	115 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807		E5RGE8	158 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807		K7EPK0	472 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	RAB29	O14966	203 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	ST8SIA3	O43173	380 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	BCL2L11	O43521	198 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	PROP1	O75360	226 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	PITX3	O75364	302 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	IGKV1-39	P01597	117 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	RBP4	P02753	201 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	IGKV1D-39	P04432	117 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	MMP9	P14780	707 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	DAO	P14920	347 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	KIR2DS2	P43631	304 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	GPR12	P47775	334 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	DLX6	P56179	175 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	TMEM33	P57088	247 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	S100A10	P60903	97 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	RELB	Q01201	579 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	ID3	Q02535	119 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	ZNF596	Q8TC21	504 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	RAB1C	Q92928	201 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	TIMD4	Q96H15	378 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	CHODL	Q9H9P2	273 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	MIOX	Q9UGB7	285 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	RNF150	Q9ULK6	438 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	NSG2	Q9Y328	171 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807		A0A1W2PPH5	198 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	OVOL3	O00110	214 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	TAAR5	O14804	337 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	TSC22D2	O75157	780 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	LY6G6D	O95868	133 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	IGKV1-5	P01602	117 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807		P0C879	139 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	LYNX1	P0DP58	116 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	OMG	P23515	440 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	P2RY1	P47900	373 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	ARHGDIB	P52566	201 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	ZNF134	P52741	427 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	ZNF137P	P52743	207 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	AKR1C2	P52895	323 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MECP2-208	ENST00000481807	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		6.53	□□□□□ -1.36

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