RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 KIFC1Q9BW19 673 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 GID8Q9NWU2 228 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC23A2Q9UGH3 650 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-209ENST00000473406 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
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RABGGTB-209ENST00000473406 SH2D1AO60880 128 aa3.65□□□□□ -1.83
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RABGGTB-209ENST00000473406 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 AKR1C2P52895 323 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 BTN3A2P78410 334 aa3.65□□□□□ -1.83
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RABGGTB-209ENST00000473406 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF676Q8N7Q3 588 aa3.65□□□□□ -1.83
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RABGGTB-209ENST00000473406 HIST1H2BAQ96A08 127 aa3.65□□□□□ -1.83
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RABGGTB-209ENST00000473406 VPREB3Q9UKI3 123 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 U3KQK5 164 aa3.65□□□□□ -1.83
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF532Q9HCE3 1301 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0B4J2C4 111 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4C46A6NHA9 309 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
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RABGGTB-209ENST00000473406 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2D3Q8NGH3 330 aa3.64□□□□□ -1.83
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RABGGTB-209ENST00000473406 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa3.64□□□□□ -1.83
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RABGGTB-209ENST00000473406 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 YEATS2Q9ULM3 1422 aa3.63□□□□□ -1.83
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RABGGTB-209ENST00000473406 TAS2R45P59539 299 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP10-12P60413 245 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB14P61106 215 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
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RABGGTB-209ENST00000473406 SLC35F6Q8N357 371 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 RPRMLQ8N4K4 120 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00477Q96M19 166 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 CNBD2Q96M20 576 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 CENPHQ9H3R5 247 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 ARMC1Q9NVT9 282 aa3.63□□□□□ -1.83
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RABGGTB-209ENST00000473406 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 THADAQ6YHU6 1953 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV40A0A0B4J280 105 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 KNCNA6PVL3 124 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 H3BQ85 93 aa3.62□□□□□ -1.83
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RABGGTB-209ENST00000473406 RUNX1Q01196 453 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 PYCR3Q53H96 274 aa3.62□□□□□ -1.83
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RABGGTB-209ENST00000473406 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 MCFD2Q8NI22 146 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 CD200R1Q8TD46 325 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB2BQ8WUD1 216 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 STARD4Q96DR4 205 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 ENY2Q9NPA8 101 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR84Q9NQS5 396 aa3.62□□□□□ -1.83
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