RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 HLA-DQB1P01920 261 aa15.63■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 OR5H8P0DN80 308 aa15.63■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 CBX5P45973 191 aa15.63■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 THBS3P49746 956 aa15.63■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 RORCP51449 518 aa15.63■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 LUMP51884 338 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 RPS16P62249 146 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 ACOT12Q8WYK0 555 aa15.63■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 PARP11Q9NR21 331 aa15.63■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 ATP6V0E1O15342 81 aa15.62■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 SPDEFO95238 335 aa15.62■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 TAS2R20P59543 309 aa15.62■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 CFHR3Q02985 330 aa15.62■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 FOXE3Q13461 319 aa15.62■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 PSG5Q15238 335 aa15.62■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF645Q8N7E2 425 aa15.62■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 ADTRPQ96IZ2 230 aa15.62■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 CMTM3Q96MX0 182 aa15.62■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 SLC22A5O76082 557 aa15.61■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 IGHG4P01861 327 aa15.61■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 APOA1P02647 267 aa15.61■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 ELANEP08246 267 aa15.61■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 DUTP33316 252 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 CBX3Q13185 183 aa15.61■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 RTL8BQ17RB0 113 aa15.61■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 IFT46Q9NQC8 304 aa15.61■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 WSB1Q9Y6I7 421 aa15.61■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa15.6■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 MEIS3P1A6NDR6 274 aa15.6■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 G3V318 75 aa15.6■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 FCN1O00602 326 aa15.6■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 TUSC2O75896 110 aa15.6■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 PF4P02776 101 aa15.6■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 FCER2P06734 321 aa15.6■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 IGKV1-13P0DP09 117 aa15.6■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 RRASP10301 218 aa15.6■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 CX3CL1P78423 397 aa15.6■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 DEFA6Q01524 100 aa15.6■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 RNF152Q8N8N0 203 aa15.6■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 BVESQ8NE79 360 aa15.6■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 AP3S1Q92572 193 aa15.6■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 SNAPC3Q92966 411 aa15.6■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 NECAP2Q9NVZ3 263 aa15.6■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 TRAV41A0A0B4J266 112 aa15.59■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa15.59■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 NUDT19A8MXV4 375 aa15.59■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 SLC25A17O43808 307 aa15.59■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 SLC6A1P30531 599 aa15.59■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 FCGR2CP31995 323 aa15.59■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 LGALS7P47929 136 aa15.59■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 NDPQ00604 133 aa15.59■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 C1QL4Q86Z23 238 aa15.59■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa15.59■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 DDB2Q92466 427 aa15.59■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 HARBI1Q96MB7 349 aa15.59■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 CLCC1Q96S66 551 aa15.59■□□□□ 0.09
CTPS1-206ENST00000470271 LINC00473A8K010 186 aa15.58■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 SHOXO15266 292 aa15.58■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 HPGDSO60760 199 aa15.58■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 PSMB8P28062 276 aa15.58■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 PPIFP30405 207 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 PRSS3P35030 304 aa15.58■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM177Q53S58 311 aa15.58■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 MZT2AQ6P582 158 aa15.58■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF562Q6V9R5 426 aa15.58■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 LCNL1Q6ZST4 164 aa15.58■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 C18orf65Q6ZTR6 163 aa15.58■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF695Q8IW36 515 aa15.58■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 OR5AP2Q8NGF4 316 aa15.58■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 ABHD5Q8WTS1 349 aa15.58■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 G3V4G9 280 aa15.57■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 CA2P00918 260 aa15.57■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 IGLV2-14P01704 120 aa15.57■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 IGLV2-23P01705 113 aa15.57■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 CD33P20138 364 aa15.57■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 AADACP22760 399 aa15.57■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 CDK10Q15131 360 aa15.57■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 ECSCRQ19T08 205 aa15.57■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 SAMD5Q5TGI4 173 aa15.57■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 C8orf86Q6ZUL3 223 aa15.57■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 PPP1R27Q86WC6 154 aa15.57■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 WFDC9Q8NEX5 89 aa15.57■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 TPSG1Q9NRR2 321 aa15.57■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 ANAPC10Q9UM13 185 aa15.57■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 FBXO7Q9Y3I1 522 aa15.57■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 CRYZL1O95825 349 aa15.56■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 PPYP01298 95 aa15.56■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 ELK1P19419 428 aa15.56■□□□□ 0.08
CTPS1-206ENST00000470271 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms