RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 UCHL3P15374 230 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-205ENST00000462042 HSD11B1P28845 292 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-205ENST00000462042 MAP2K4P45985 399 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-205ENST00000462042 MARCKSL1P49006 195 aa2.81□□□□□ -1.96
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RABGGTB-205ENST00000462042 PRDX4Q13162 271 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.81□□□□□ -1.96
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RABGGTB-205ENST00000462042 DEFB125Q8N687 156 aa2.81□□□□□ -1.96
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RABGGTB-205ENST00000462042 OR51D1Q8NGF3 324 aa2.81□□□□□ -1.96
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RABGGTB-205ENST00000462042 UPK3BQ9BT76 320 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC2A9Q9NRM0 540 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-205ENST00000462042 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-205ENST00000462042 COL18A1P39060 1754 aa2.81□□□□□ -1.96
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RABGGTB-205ENST00000462042 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
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RABGGTB-205ENST00000462042 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa2.8□□□□□ -1.96
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RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM33P57088 247 aa2.8□□□□□ -1.96
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RABGGTB-205ENST00000462042 BAP18Q8IXM2 172 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-205ENST00000462042 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
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RABGGTB-205ENST00000462042 TVP23CQ96ET8 276 aa2.8□□□□□ -1.96
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RABGGTB-205ENST00000462042 DIRAS2Q96HU8 199 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-205ENST00000462042 PECRQ9BY49 303 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-205ENST00000462042 R4GN34 69 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-205ENST00000462042 FLT4P35916 1363 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF407Q9C0G0 2248 aa2.79□□□□□ -1.96
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RABGGTB-205ENST00000462042 SMIM9A6NGZ8 99 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-205ENST00000462042 GGTLC3B5MD39 225 aa2.79□□□□□ -1.96
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RABGGTB-205ENST00000462042 APOMO95445 188 aa2.79□□□□□ -1.96
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RABGGTB-205ENST00000462042 OR2T27Q8NH04 317 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-205ENST00000462042 TLNRD1Q9H1K6 362 aa2.78□□□□□ -1.96
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RABGGTB-205ENST00000462042 A8MWP6 167 aa2.77□□□□□ -1.97
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RABGGTB-205ENST00000462042 TAF9Q16594 264 aa2.77□□□□□ -1.97
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RABGGTB-205ENST00000462042 HIST2H3AQ71DI3 136 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF664Q8N3J9 261 aa2.77□□□□□ -1.97
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RABGGTB-205ENST00000462042 LHFPL5Q8TAF8 219 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-205ENST00000462042 MUC7Q8TAX7 377 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-205ENST00000462042 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-205ENST00000462042 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-205ENST00000462042 SDK2Q58EX2 2172 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-205ENST00000462042 GRIN2BQ13224 1484 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-205ENST00000462042 SHANK3Q9BYB0 1731 aa2.76□□□□□ -1.97
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