RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 P01737 135 aa14.01□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 APCSP02743 223 aa14.01□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 MPV17P39210 176 aa14.01□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 HSPB9Q9BQS6 159 aa14.01□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.01□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A0A6YYD4 124 aa14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC3CA6NJW4 275 aa14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 J3QR89 54 aa14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL11P62913 178 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF826PQ6ZT77 177 aa14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 LHFPL1Q86WI0 220 aa14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 OR5P3Q8WZ94 311 aa14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ZIC3O60481 467 aa14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 NHLH1Q02575 133 aa14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 TNXAQ16473 311 aa14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM45BQ96B21 275 aa14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 AUP1Q9Y679 476 aa14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 J3QW42 95 aa14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ISLRO14498 428 aa14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 S1PR2O95136 353 aa14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 LYZP61626 148 aa14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 PERPQ96FX8 193 aa14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 K7ESF4 209 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 SMPD2O60906 423 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 NRN1LQ496H8 165 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 MIC13Q5XKP0 118 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 PQLC2Q6ZP29 291 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 CBY3A6NI87 242 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM183AQ8IXX5 376 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF596Q8TC21 504 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 IL36RNQ9UBH0 155 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 IL17BQ9UHF5 180 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 CACNA1EQ15878 2313 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 VENTXO95231 258 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 HOXA5P20719 270 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM117AQ9C073 453 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 OR5AL1P0C617 328 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 COL8A1P27658 744 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 C18orf12Q96KH6 178 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 MED12Q93074 2177 aa13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM265A0A087WTH1 108 aa13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 MFAP2P55001 183 aa13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 PILRBQ9UKJ0 227 aa13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ASXL3Q9C0F0 2248 aa13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 CD5P06127 495 aa13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 PTGDSP41222 190 aa13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 GCSAMQ8N6F7 178 aa13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 DDA1Q9BW61 102 aa13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 CYTL1Q9NRR1 136 aa13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1W2PPE3 182 aa13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ODAMA1E959 279 aa13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 SHISA5Q8N114 240 aa13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 SPEM2Q0P670 501 aa13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 CLDND2Q8NHS1 167 aa13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 LYZL4Q96KX0 146 aa13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 NLRC5Q86WI3 1866 aa13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 P2RY6Q15077 328 aa13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 Q56UQ5 140 aa13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 CEP250Q9BV73 2442 aa13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 KLK10O43240 276 aa13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 NEURL1O76050 574 aa13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 REC114Q7Z4M0 266 aa13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM216AQ8WUB2 273 aa13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 SAP30LQ9HAJ7 183 aa13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 RFPL3SP0C7P2 107 aa13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 OR2D3Q8NGH3 330 aa13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 THYN1Q9P016 225 aa13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 HLA-DQA1P01909 254 aa13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 FHL1Q13642 323 aa13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 GAMTQ14353 236 aa13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 LRTM2Q8N967 370 aa13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 PAXXQ9BUH6 204 aa13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 PRR19A6NJB7 356 aa13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF785A8K8V0 405 aa13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms